なとろむさんによる甲状腺がん患者数の見積もり(ベイズの定理)

親なとろむ3.5人(ポチ0.5、早川、奥村、早野) 反なとろむ3人(牧野、玄妙、study)
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リンク NATROMの日記 そんで、結局のところ、甲状腺癌の患者数は? そんで、結局のところ、甲状腺癌の患者数は? 福島県の子供に対する甲状腺検査において、2次検査で細胞診..
Pochipress @pochipress

陽性反応的中割合と「100%引く偽陽性率」を取り違えた甲状腺癌数の推計について - NATROMの日記 (id:NATROM / @NATROM) http://t.co/h8D6qt6Fkw 2かけ2表は津田教授でさえ混同することがあるのか、おっそろしい世界だなあ。

2013-03-16 10:45:38
早川由紀夫 @HayakawaYukio

「甲状腺癌の2次検査の細胞診検査において7名が悪性と診断された。この検査の感度は90%(偽陰性率10%)、特異度は90%(偽陽性率10%)である。この7名のうち真に甲状腺癌であるのは何人か?」 http://t.co/gue7om9rB3 ベイズの定理じゃん。あのむつかしいやつ。

2013-03-16 10:51:48
早川由紀夫 @HayakawaYukio

↓ これは大学院生レベルの問題だ。なとろむさん、むちゃくちゃ頭いいからなあ。じゃ、読んでみるか。

2013-03-16 10:54:30
早川由紀夫 @HayakawaYukio

なとろむさん14日エントリから先に読むとよい。http://t.co/A79iUtMacf 「有病割合がきわめて低いと、検査で陽性の結果が出た人の大半が偽陽性である。」 まさしくベイズの定理を語ってる。

2013-03-16 11:04:23
Pochipress @pochipress

NATROMさんほどの人でも薄氷を踏む思いで記述しているんだな、すごいよね。

2013-03-16 11:16:38
Jun Makino @jun_makino

まあその、感度 90% とか特異度 90% が、 2 桁の有効数字をもって正確なら 意味がある議論。例えば特異度 90% が実は 95% だったら数字は全然変わる。 「 90% 」と書いてある時点で 2 桁めは誤差を含んでいる可能性が高い ことに注意する必要あり。

2013-03-16 11:17:54
Jun Makino @jun_makino

95% なら偽陽性は 3-4 人で、真の患者は 6-7 人となる。

2013-03-16 11:17:56
早川由紀夫 @HayakawaYukio

なとろむさんは2かけ2表で「病気あり陽性」を2.7としているが、これを3.0とする。 感度=特異度=yとすると、xy = 3 かつ x + 76y = 72 だ。これを解くと、y = 0.89、病気あり合計x = 3.37になる。 http://t.co/oZXHgYeyYH

2013-03-16 14:29:26
早川由紀夫 @HayakawaYukio

感度と特異度が89%程度だと、検査で陽性と判定される10人のうち7人が実際には病気なしであることを、もっと多くの人が知る必要がある。

2013-03-16 14:38:41
二十人のろの夢 @drsteppenwolf

このカルク http://t.co/ztc27jLW80 … で検算しましたが、OKだと思います。 @HayakawaYukio  http://t.co/iIwjom0JIE

2013-03-16 15:14:52
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studying @kotoetomomioto

がん診療ガイドライン http://t.co/VCAwzDGPa7 「偽陽性、偽陰性割合ともに10%未満」:から推定される今回検査の特異度は98%、感度58%、最大発症数16人 http://t.co/Qw9OcUJCor

2013-03-16 19:36:59
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Haruhiko Okumura @h_okumura

陽性反応的中割合と「100%引く偽陽性率」を取り違えた甲状腺癌数の推計について http://t.co/FNT5nhE2UI こういう確率の基本をぜひ学校で教えてほしい

2013-03-17 09:37:44
ryugo hayano @hayano

ベイズの定理 @h_okumura: 陽性反応的中割合と「100%引く偽陽性率」を取り違えた甲状腺癌数の推計について http://t.co/y9L7NXeBJ2 こういう確率の基本をぜひ学校で教えてほしい

2013-03-17 09:43:20
早川由紀夫 @HayakawaYukio

で、24時間たったけど、これ、あってんだろか。「甲状腺検査の疫学 http://t.co/07LjY0PtbP

2013-03-17 15:26:03
早川由紀夫 @HayakawaYukio

玄妙さん以外だれからも反応がないんだが、つぎのどれ?1大間違いはなはだしくて話にならない、2興味ないし自分には関係ない、3なにを問題にしてるんだかわかんない、4むずかしくて理解できない、5あってるから納得。

2013-03-17 15:28:41
早川由紀夫 @HayakawaYukio

まあ、たしかに、これより数段むずかしい。「セシウムの放出総量 http://t.co/TLRIVBsTOq これは学部レベルだが、あれは大学院レベルだ。

2013-03-17 15:30:11
Jun Makino @jun_makino

@study2007 あ、すみません、ここで「偽陰性」の定義はこれで正しいですか?「本当は陽性なんだけど検査では陰性になる割合」、つまり、1-感度では?

2013-03-17 18:05:59
二十人のろの夢 @drsteppenwolf

6.3人が甲状腺がんと診断され、これまでの3人とあわせると9.3人。66人の中に偽陰性で甲状腺がんと診断されていない子どもが10%だと6.6人。これだと感度59%、特異度99%。 http://t.co/oATO48Zvw1

2013-03-17 18:37:31
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二十人のろの夢 @drsteppenwolf

感度90%、特異度90%なら、こんな感じで甲状腺がんは3.34人だと思う。 http://t.co/4PlVUbTJGT

2013-03-17 18:49:36
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二十人のろの夢 @drsteppenwolf

陽性的中率(PPV)と陰性的中率(NPV)が9割以上と考えるのならば、甲状腺がんは16人で間違っていないと思います。(感度59%、特異度99%) http://t.co/oATO48Zvw1

2013-03-17 19:32:51
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studying @kotoetomomioto

あ、すいません間違ってました。かつ、今の段階では仮定するしかなくて、こういう感じだとこういう感じになりました。「偽陰性、偽陽性10%未満」を満たすにはこういう水準なんですがどうでしょうか?@jun_makino http://t.co/gxP0cMboZy

2013-03-17 19:43:58
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studying @kotoetomomioto

補足)これだと一応「残り7人中8割」も満たします。偽陽性がこんなに低いかな?という気もしますが、元々76人検査して10人くらいしか陽性にならない検査なので(分母が大きくなるわけで)、まあ、そういうものかも知れませんが、、。@jun_makino

2013-03-17 19:46:18
Jun Makino @jun_makino

@study2007 あ、大丈夫そうに見えます。偽陽性 1.5% は低いといっても、7人中8割と整合させるにはその値しかない、ということですよね、、、

2013-03-17 20:04:07