名古屋市の子宮頸癌ワクチンアンケート調査データの解析に挑む

名古屋市が公費で実施した子宮頸がんワクチンアンケート調査の公表済み速報結果を引っ込め、生データだけをPDFで公表したもののそれ以上の解析はせず結果も出さないと言明。このデータを変換して再解析しようするネット上の動きを追いました。新情報は随時追加予定です。 名古屋市ウェブサイトから削除された速報結果のアーカイブ https://web.archive.org/web/20151223190255/http://www.city.nagoya.jp/kenkofukushi/cmsfiles/contents/0000073/73419/sokuhou.pdf 名古屋市ウェブサイトのデータ公表コーナー(2017年2月1日現在こちらに移転) http://www.city.nagoya.jp/kenkofukushi/page/0000088972.html 続きを読む
121
前へ 1 2 3 ・・ 20 次へ
おーちゃん @nyaos_nyagos

データの解析結果に対して情報開示請求がかかったら、開示しない理由が見当たらないと思うけど…… 正しくは「速報と変わらず因果関係なし」 名古屋市子宮頸がんワクチン副反応疫学調査「事実上撤回」の真相 (WEDGE Infinity) bit.ly/28Zu7ok

2016-06-28 21:20:14
地下楽師@Ph.D @tonkyo_Vc

一応テキストデータでのraw data公開をするように要望した→名古屋市:子宮頸がん予防接種調査の結果を報告します(暮らしの情報) city.nagoya.jp/kenkofukushi/p…

2016-06-27 23:13:35

(結局CSVファイルの公開は拒否)

⅃ЯAƎ⊿せかんどらいふすたあと @DrMagicianEARL

名古屋市からメールで回答がきました。改変を防ぐためpdfのままでいくとのことで、CSVファイル提供もお願いしていましたがダメでした。 じゃあさ せめてpdfのままでもいいからちゃんと解析可能なフォーマットにしてくんない? twitter.com/drmagicianearl…

2016-06-28 17:30:52

データの一部を解説して下さった方々

地下楽師@Ph.D @tonkyo_Vc

名古屋市のHPVVの調査データ、接種群(赤)と非接種群(青)の年齢分布をグラフにしてみたけど、これは明らかに年齢分布が異なっているので、年齢調整したオッズ比出さなければいかんですね。 city.nagoya.jp/kenkofukushi/c… pic.twitter.com/cGHHzmTue8

2016-06-27 23:29:05
拡大
⅃ЯAƎ⊿せかんどらいふすたあと @DrMagicianEARL

クレーム団体からの圧力のみで子宮頸がんワクチンの科学的結論を撤回させられる名古屋市と、市の管理下にあるからとそれ以上の解析をしない名古屋市立大学な。それでもアカデミアかよ

2016-06-27 11:34:09
五味馨 @keigomi29

委託業務ならば受託者の義務として委託者の許可なく内容を公表しないという契約をするのが普通。今回もそうなのであれば、鈴木教授としても契約違反は出来ない。

2016-06-27 13:20:11
五味馨 @keigomi29

アカデミアとして筋を通すならそういう制約のかからない(無論プライバシー保護等は当然必要)予算を使って自ら調査するべき。

2016-06-27 13:22:05
五味馨 @keigomi29

生データと書いてあるので見に行ってみたら本当に表に入力しただけの生データも公開されてた。(「調査回答データ」) city.nagoya.jp/kenkofukushi/p…

2016-06-27 13:37:32
五味馨 @keigomi29

子宮頸がん予防接種、名古屋市の調査から単純集計で症状ありの割合を比較。年齢調整は回答データを読み込まないとできないが、単純集計は集計結果のP22に出てたので取り急ぎ。「接種あり」のほうが多いのはちょうど半分の12項目。 pic.twitter.com/g8oYB8PJMV

2016-06-27 14:05:42
拡大
拡大
五味馨 @keigomi29

このために時間休とりました。

2016-06-27 14:06:10
五味馨 @keigomi29

ちゃんとした分析は調査票を読み込んでどなたかがされるだろうと思いますので。

2016-06-27 14:07:26
五味馨 @keigomi29

まずは手を動かせ。話はそれからだ。

2016-06-27 14:07:36

PDFファイルをテキスト化しようと悪戦苦闘が続く

(その1)

k.kishida @kishida_koji

私も、acrobat dc standardで1ページだけexcelに変換してみましたが正確に変換できました。 twitter.com/pririn_/status…

2016-06-27 12:11:34
k.kishida @kishida_koji

@pririn_ @h_okumura @MinatoNakazawa 全体の変換を試みましたが、途中でこけました。多分ページ数が多すぎるのだと思うので、幾つかに分割して変換しなければならないかも。ちなみに、MBPで実行しました。

2016-06-27 12:39:01
Haruhiko Okumura @h_okumura

名古屋のPDFをExcelに変換される際には,1-155ページが一番左の部分,156-311ページがその右,…と2429ページまで続くという構造を踏まえてお願いします twitter.com/kishida_koji/s…

2016-06-27 12:52:13
Haruhiko Okumura @h_okumura

この構造さえわかればAcrobatでもがんばればPDFからExcelファイルが復元できる。どなたか着手されているなら待ちます。別件(原稿)を済ませてまだどなたも手をつけてないなら私がするしかない? twitter.com/h_okumura/stat…

2016-06-27 22:57:46
k.kishida @kishida_koji

@h_okumura とりあえず、最初の6000人分については着手しています。もし、他にも作業されている方がいらっしゃるなら残りのファイルをお願いします。綺麗に変換させるためにちょっと前処理が面倒臭くて。

2016-06-28 00:15:00
Haruhiko Okumura @h_okumura

.@kishida_koji おお,ありがとうございます!

2016-06-28 07:26:09
k.kishida @kishida_koji

@h_okumura すいません、完全に行き詰まってます。776-930ページを変換すると、各ページの下の10行弱が無視されて、変換されません。6000件中4600件くらいしか変換できません。

2016-06-28 19:05:05
k.kishida @kishida_koji

@h_okumura これらのページをword変換してみると、下の無視される行は、文書の本文の範囲外のフッターの領域に表示されています。これらの行はpdf表示でみれるのですが、ページ本文の範囲外になっているみたいなのです。

2016-06-28 19:10:20
Haruhiko Okumura @h_okumura

@kishida_koji お手数かけてすみませんでした。やっぱり難しいですか。私も暇を見て別の方法で試してみます

2016-06-28 21:00:09
前へ 1 2 3 ・・ 20 次へ