名古屋市の子宮頸癌ワクチンアンケート調査データの解析に挑む
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奥村先生のホームページに情報が集約されはじめた
名古屋のHPVVデータ,チェックのために私も不完全ながら独立に作ってみました。バグ:列229は006001-024000でNAになっていますが実際には一部データがあります oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/…
2016-06-29 15:54:16さっき名古屋市のPDFをCSVするときに使ったRスクリプトと若干の説明を oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/… に書いておいた。やっつけ仕事なのでひどいコーディングだorz
2016-06-29 16:49:50@h_okumura 名古屋のpdfはPostScriptに変換すると(pdf2psよりもpopplerのほうが見やすいpsをだすようです)頁と座標が分かるので、最後の記入欄も何番目の人のものかが判別できると思います。
2016-06-29 20:25:05やってください ;-) RT @tsubu_02: @h_okumura 名古屋のpdfはPostScriptに変換すると(pdf2psよりもpopplerのほうが見やすいpsをだすようです)頁と座標が分かるので、最後の記入欄も何番目の人のものかが判別できると思います。
2016-06-29 20:51:16昼間アップしたCSVファイルはUTF-8でしたが支障あるかたおられますでしょうか(ファイルが見当たらない…と思ったらcontributedの綴りが1文字欠けていたorz 正しい綴りにハードリンクしておく)
2016-06-29 22:13:33@h_okumura という訳で初めのpdfについて、最終列の自由回答が書かれているページ,(絶対)行の情報をファイルに上げてみました。(最初のページのp.2171はメチャクチャで他も丸め誤差は無考慮) パスは最初のページの数。 @kumikokatase
2016-06-30 12:14:19@h_okumura @kumikokatase アップロードしたURLは fast-uploader.com/file/702281183… です。
2016-06-30 12:15:27@tsubu_02 @kumikokatase パスワードが設定されているようでダウンロードできませんでした
2016-06-30 12:38:25@tsubu_02 @kumikokatase 見落としていました。失礼しました。ダウンロードしました。しかし必要なのは座標ではなくデータですので,今のところお役立てすることができません
2016-06-30 12:56:06@h_okumura 次のスクショのようなことができれば良いということでしょうか。(とりあえず解析の段階) pic.twitter.com/FetaSVcCVy
2016-06-30 20:13:27@tsubu_02 ありがとうございます。残る課題は oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/… のCSVで欠けている列275と,ほとんど欠損値になっている列229を補うことです。座標を求めることは私にもできるのですが,CSVにデータを埋めることはけっこう面倒です
2016-06-30 20:53:11@h_okumura 取り出せない原因は埋め込みフォントが腐ったエンコーディングを使っている(件のスクショがその順番)ことだと思われます(-_-)
2016-06-30 21:08:12@h_okumura 現在のところは次のとおりです(%%%はPSに埋め込む予定のためのコメント指定) pic.twitter.com/kyIz6C82n2
2016-07-01 22:23:02@h_okumura fast-uploader.com/file/702299920… でパスワードは同じです。(%%% でpsにコメントとして埋め込み。印刷の向きはなぜか180回転になっています)
2016-07-02 16:17:00名古屋市、「論文化は自由」と言い出すも機械可読データの提供は拒否
名古屋市にお聞きしたところこのワクチン調査データ city.nagoya.jp/kenkofukushi/p… 、独自に解析・学術論文化してよいとのこと。論文化の際に必要なメソッド等各種情報は、健康福祉局健康部保健医療課が窓口でメールで問い合わせ可。早い者勝ちなので、意欲のある研究者はぜひ。
2016-06-29 18:56:30@tsuyomiyakawa なおエクセルファイル、テキストファイル等でデータをいただくことは可能でしょうか、という質問に対しては、「調査回答データにつきましては、改変されることのないよう、PDFファイルで公表しております。」とのことでした。
2016-06-29 19:05:59@tonkyo_Vc 要は名古屋市が市のホームページで結果を公表したくないのなら、名古屋市大に論文公表を認めればいいだけの話。たとえ業務委託契約で依頼者の許可なく業務の内容や結果を公表できない取り決めになっていたとしても、依頼者の名古屋市が公表を認めればいいのですから。
2016-06-30 10:13:27@tonkyo_Vc これ名古屋市大が単に名古屋市が実施したアンケートの結果を渡されて集計とデータ解析と結果取りまとめを業務委託されていただけなのか、それとも正式の臨床研究として事前に学内の倫理委員会の承認を取った上で着手していたのか。論文化するにも投稿規定で倫理審査クリアは必須
2016-06-30 10:09:49