「メタボロミクス研究の最前線とメタボライトデータベースの役割」つぶやきまとめ

2010/01/15に行われた、日本学術会議シンポジウム「メタボロミクス研究の最前線とメタボライトデータベースの役割」(poster: http://www.scj.go.jp/ja/event/pdf/85-s-2-1.pdf )のつぶやきを、 @orenotwitter さんのpostを中心にまとめました。途中から #metabo ハッシュタグがついてますが、今回は手元のhtmlからまとめています。
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【完全引退】 @orenotwitter

日本学術会議シンポジウム「メタボロミクス研究の最前線とメタボライトデータベースの役割」

2010-01-15 09:56:59
【完全引退】 @orenotwitter

「生命システム情報統合KEGGとメタボロミクス研究」金久實(京大化研バイオインフォマティクスセンター)

2010-01-15 09:58:34
【完全引退】 @orenotwitter

生命を構成する基本分子 ゲノム空間とケミカル空間

2010-01-15 10:00:44
【完全引退】 @orenotwitter

ハイスループット実験プロジェクト ゲノム空間とケミカル空間の関連

2010-01-15 10:02:01
【完全引退】 @orenotwitter

バイオインフォマティクスの方法論 システム空間でのゲノム空間とケミカル空間の統合

2010-01-15 10:03:34
【完全引退】 @orenotwitter

システム空間での創薬・医療への応用

2010-01-15 10:04:44
【完全引退】 @orenotwitter

単一遺伝子疾患でも多因子性疾患も分子ネットワークを使って統一的に理解できる

2010-01-15 10:06:21
【完全引退】 @orenotwitter

以前より分子レベルのデータベースはあったがシステムレベルのDBがなかったのでKEGGを作った

2010-01-15 10:07:36
【完全引退】 @orenotwitter

KEGGは大量データを解釈するためのリファレンス

2010-01-15 10:08:08
【完全引退】 @orenotwitter

KEGG GLYCANのエントリ数増えてないなー

2010-01-15 10:08:50
【完全引退】 @orenotwitter

高次生命システム機能の知識表現〜グラフ(パスウェイマップ)、単純リスト(メンバーシップ)、階層リスト(オントロジー)

2010-01-15 10:10:47
【完全引退】 @orenotwitter

1143ゲノム中KOがついている遺伝子は35%

2010-01-15 10:14:52
【完全引退】 @orenotwitter

KOARA: KEGG Orthology And Links Annotation

2010-01-15 10:16:00
【完全引退】 @orenotwitter

KOを決めるとパスウェイやBRITEにマッピングできるようになる

2010-01-15 10:20:17
【完全引退】 @orenotwitter

糖転移に関係するKOのリストがわかると、糖鎖の構造が推定できるらしい

2010-01-15 10:21:00
【完全引退】 @orenotwitter

Chemical structure transformation networks 酵素が改変する化学構造、人が改変する化学構造(薬など)のネットワーク

2010-01-15 10:27:43
【完全引退】 @orenotwitter

RDMパターン(酵素反応で改変される原子のパターン)を使って化合物の合成経路を予測する

2010-01-15 10:31:01
【完全引退】 @orenotwitter

Chemical reaction pattarn でも同じようなことをやりたいけど、これから。パターン化は終わっていてD2O君の仕事

2010-01-15 10:32:37
【完全引退】 @orenotwitter

構造の推定の次にどういう薬効があるのかを予測できるようにしたい

2010-01-15 10:40:58
【完全引退】 @orenotwitter

田中耕一さんがいた。質問しとる

2010-01-15 10:43:13
【完全引退】 @orenotwitter

マススペクトルの公開および活用のための研究者コンソーシアム型データベースMassBank

2010-01-15 10:52:21
【完全引退】 @orenotwitter

メタボーロム解析 ほとんど質量分析(一部NMR) 測定範囲 m/z 30-3000 分子式は決まらない。仮に決まっても異性体は区別できない

2010-01-15 10:54:37
【完全引退】 @orenotwitter

MS/MSで異性体をある程度区別できる

2010-01-15 10:56:31
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