「糖鎖インフォマティクスシンポジウム」つぶやきまとめ
例によって例のごとく私自分用まとめ。ハッシュタグglycoinfoの発言に、その周辺の人のつぶやきを少し足し引きし...たはずなのですが、まだ過不足あるかも知れません。編集自由です。シンポジウムのページはこちらから http://www.rings.t.soka.ac.jp/symposium/
Maori Ito
@maoringo
糖鎖インフォマティクスのシンポジウムが始まってます。CSEditor:2次元分子構造描画ツール。どこがO1かなども分かるらしい。Windowsのみなのが残念。http://glyconavi.org/cseditor/download.htm
2011-02-25 10:44:29
Nakazato T.
@chalkless
@maoringo ...多分、KEGGの中の何かだろうけど。。。PubChemとかChEBIとか。まぁ、いずれにしても使いにくいような。。。
2011-02-25 11:00:14
Maori Ito
@maoringo
Glycoscience Explorerでキーワードによる統合検索ができる。(今はα版で4月に最新版を公開予定とのこと)http://jcggdb.jp/idb/jsp/GlycoExplorer.jsp
2011-02-25 11:02:44
Maori Ito
@maoringo
糖鎖構造検索も統合されたらしい。構造や部分一致など様々な検索方法があるみたい。ここで使ってる化学構造検索エンジンはJChem Baseとのこと。http://jcggdb.jp/GlycoChemSearch/
2011-02-25 11:19:38
Maori Ito
@maoringo
糖タンパク質統合DBを作成中だが、産総研での実験からのデータや論文からデータを取ってきているが情報が少ないなどもあり、まだ公開してない。#glycoinfo
2011-02-25 11:31:12
Maori Ito
@maoringo
病原体と宿主の結合情報に関するDB http://jcggdb.jp/search/PACDB.cgi 論文から情報を抽出。#glycoinfo
2011-02-25 11:32:22