回折写真のバックグラウンドがぼんやりした汚い状態になるのって,何が原因なんだろう.溶媒の状態?大きい結晶でなりやすい?分解能が3A程度の結晶に多い?
2011-05-19 17:41:47@yam_cpp 全く同じ悩みを持っています…成長の早い(1日とか)でなり易い傾向がある気がします.>ぼんやりバックグラウンド
2011-05-19 17:46:30@nsakaii こんな感じのですか?成長の早さとの関係はあまり実感が無いです.同じタンパク質の結晶でも,バックが綺麗な時とそうじゃない時があります. http://twitpic.com/4zkypt
2011-05-19 17:55:19@yam_cpp 汚いって「模様」になってるなら散漫散乱? でも最近のCCDでの微小振動角の短時間露光の写真だと,あんまり目立たない気がするけど…
2011-05-19 17:55:30個人的には散漫散乱のパターンをぼんやり見ていると結構楽しいけど,それでダイナミクスの研究に展開してみようとしたことはないな… QT @yam_cpp: @nsakaii こんな感じのですか? http://twitpic.com/4zkypt
2011-05-19 18:01:53@ishi_game 散漫散乱というと,格子欠陥(あまり具体的なイメージが無いのですが)が原因でBragg反射と同じ位置に出るぼんやりしたピークのことですか?どんな時に現れるのでしょうか?
2011-05-19 18:05:02@yam_cpp 蛋白質結晶で真面目にやっている人はそう居ないと思うけど,例えば…Jean-Pierre Benoit は去年のACAでもポスターを出してた http://goo.gl/GsRCD 昔は郷さんのグループもやっていたんじゃないかな…
2011-05-19 18:11:42@ishi_game たしかにバックの濃い位置とBragg反射の位置は一致していますね(mosaicityをあげてpredictionを見ればほぼ重なります;重ならない部分もありますが).
2011-05-19 18:14:24このスライドにdiffuse scatteringの説明が. "Protein Crystallography with Pixel Detectors" http://detws.web.psi.ch/detws/talks/schulze.pdf
2011-05-19 18:32:49ごめん記憶違いだった.ACAで蛋白質結晶の散漫散乱のポスターを出してたのは D Riccardi でした QT @ishi_game: @yam_cpp 蛋白質結晶で真面目にやっている人はそう居ないと思うけど
2011-05-19 22:34:18@ishi_game そうなのですか.IUCrでもポスターを出してくれることを期待です..さきほど,分子間でディスオーダがある場合にdiffuse streakが現れるとの記述を見たのですが,これはある軸方向にだけ伸びた逆格子点として観測されるのでしょうか.
2011-05-19 22:46:24@yam_cpp IUCr行くの? 私は散漫散乱はちゃんと勉強したことが無いです.ディスオーダーというよりダイナミックス(分子の相関運動)の議論がされてると思うけど…
2011-05-19 23:04:36@ishi_game 今のところ,行く方向で色々調整中です. はじめに逆空間中での散漫散乱のプロファイルか何かを作って実空間での現象を議論するような感じでしょうか?どういうモデル化をしているんでしょう..
2011-05-19 23:15:05さっきとは別のデータで,反射が一軸方向にだけ伸びているものがあり,それがdiffuse scatteringによるものなのか,lattice translocationによるものなのかが気になっている..
2011-05-19 23:19:56@yam_cpp 素人考えでは,実空間で動力学計算して散乱パターンをシミュレーションしそうに思うけど,相関運動を表現するために工夫があるんじゃなかったかな…良く分らん…Riccardiの論文を見つけた http://goo.gl/Z4B6p
2011-05-19 23:25:07@yam_cpp あんまり詳しくはないですが,散漫散乱についてはMethod Enzymol 277 21章に解説が.結論としては動きのクロス相関が現れるみたいですが,感じとしては分解能に関係なくpartial disorderが多い時に出る気がします.
2011-05-20 11:37:07@cuemolnohito 有り難うございます!Figを見る限り,自分が不思議に思ってた現象の説明ができそうです.これから読んでみます.分解能が良いときでも出るのは少し意外でした.
2011-05-20 12:59:27