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Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
ゲノム研究・診療用の病理組織検体取扱規定、もう無料配布は終わって、羊土社から本になったのね。 amazon.co.jp/s?k=ISBN-10%3A…
2019-09-26 14:19:25
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
備忘録。癌学会E-2007演題はスプライシング因子の変異がSWI/SNFのコンポーネントのスプライシング異常を引き起こし、ぶどう膜メラノーマに関連するという。Nature in pressとのこと。
2019-09-27 10:48:53
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
備忘録。BRCA1は相同組み換えで重要なタンパク質だが、細胞周期ではS期かG2期に限られている。この制御を司るのがH4K20me0（リジン残基にメチル化が入っていない）ということを見つけたという報告。癌学会S10-6 ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…
2019-09-27 11:10:53
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
AYA乳がんでPARP阻害剤の適応推定（＝相同組み換え欠損:HRD）に、4種の情報を活用することで効率的にできるという報告（癌学会E-2070）。約5割のHRD陽性患者を捕捉できる。残念ながらオラパリブの適応はその中でさらに半分程度らしい。でもよく錬られた良い発表でした。
2019-09-27 13:52:06
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
BBJ理研の桃澤先生の発表。乳がんと前立腺がんの遺伝性の確認を大規模に実施した論文（S18-3）JNCIに論文がある。ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=M…
2019-09-27 14:23:30
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
京都大高田穣先生、ADH5およびALDH2がFanconi貧血様のmarrow failure症候群の原因遺伝子という新規の報告。S18-4。形質の説明が難しかったが細胞種によって姉妹染色体交換の頻度が違う症例が、ADH5の両アレルの欠損で発症という話。同様にALDH2でも複数の類似症例が登録されている（多分続く）。
2019-09-27 14:36:23
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
（続き）ALDH2についてはp.K504Eという、有名な変異。これはFAの症状悪化に関連するという論文をすでに報告ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27377053
2019-09-27 14:42:46
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
（続き）ADH5の欠失アレルと野生型のヘテロはADH5の阻害剤によってSCEの頻度が増加する。さらにADH5とALDH2のジェノタイプで比べるとADH5の欠失ホモとALDH2のヘテロでフォルマリンによるSCEが増加する。
2019-09-27 14:46:53
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
（続き）特定の細胞（PHA刺激したリンパ球）がどうしてSCEが増えるのかを検証するために各ジェノタイプのiPSを作成、試験管内で血液幹細胞を作成、各ジェノタイプでの効率を比較。驚いたことに、ADH5ホモ欠失、ALDH2ヘテロの細胞はほとんど幹細胞ができない。
2019-09-27 14:50:37
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
この話のすごいところは一種のsynthetic lethalのような現象が天然で観察されているところ。2遺伝子の組み合わせで病気になる例はあまり聞いたことがない。
2019-09-27 14:56:42
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
（続き）ちょっと調べたらこの問題は根が深く、高田（たかた）先生は昔から調べていたようだ。 ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=2…
2019-09-27 15:02:05
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
最後に栃木がんセンターの菅野先生のお話。日本では核家族化が進んでいるので、国際的なリンチ症候群のクライテリアではうまく行かないので見直しをしたという話。
2019-09-27 15:04:40
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
国内のリンチ症候群らしい人のMSH2, MLH1, MSH6, PML2の４つを解析。全体で55％くらいが病的変異を同定。高リスク群だと91％にのぼる。
2019-09-27 15:07:19
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
（続き）Lynchに見えていた症例がPOLD1の変異だった家系も。これらはマイクロサテライトは安定＝リンチではない。中間リスクのグループは７９％くらい。
2019-09-27 15:09:19
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
低リスク群は34%で意外に高い。MSH6とPML2は低リスクで目立ち、MSH2, MLH1は高リスク群に目立つ。MSH2, MLH1は連鎖解析で見つかった、浸透度の高い遺伝子であることと相関がある。
2019-09-27 15:12:03
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
MSH2 p.R359Tの家系がHBOCとリンチを足したような症状を示したと。家系図からはHBOCだがBRCA1/2は野生型。
2019-09-27 15:15:22
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
MSH6 p.R976C変異がある、２２歳の腹膜癌。チップ解析でBROVCA1の欠失。調べてみるとBROVCA3, 4, 2とすべてBRCA1,2 RAD51Dが関連しているが、今回見つかったものはその領域を外れていると。
2019-09-27 15:21:23
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
国立がん研究センター東病院の保険診療でのパネル検査の経験の紹介（向原先生）。５０例程度実施し、すでに２例死亡例が出現、１例が状態が変化し治験に参加できなかったと。
2019-09-28 09:24:20
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
（続き）治験を考慮すべき、というのが全体の1/3くらい出てきているのは希望が持てる話だが、実際にはややoverestimation気味っぽい。
2019-09-28 09:26:12
Ｊｕｎ Ｙａｓｕｄａ
@jyasuda1
国立がん研究センター東病院のように体制が整っているところでも７週間かかるところで、検査をやるやらないの判断が難しいところがあるというコメント。
2019-09-28 09:31:27