- uchida_kawasaki
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系統解析をすると、たぶん新型コロナウイルスは日本に何回も来てる pic.twitter.com/0ZfJtU41Fx
2020-02-17 17:32:55株式会社日本バイオデータの公式アカウントです。バイオインフォマティクス、データ解析サービスを提供しています。Discover life by every conceivable means.
解析を進めました。Parsimony-informative sites だけで眺めると、ReferenceとしたSARS-Cov-2ゲノム(Accession No.MN908947)の8782番塩基(C/T)と28144番塩基(T/C)と29095番塩基(C/T)が重要そうでした。そこで、CTC, TCC, TCTの3グループにわけて作図しました。 pic.twitter.com/I7aXJOia9i
2020-02-19 11:47:37詳細については昨夜bioRxivにsubmitしたのでそのうち公開されるとは思いますが、ひとまずそれまではここに置いておきます。 med-mec.com/data/20200219_…
2020-02-19 11:51:48arXivで論文が公開されました arxiv.org/abs/2002.08802 塩基配列データは下記リンクにあります med-mec.com/data/all.parsn…
2020-02-21 10:57:11武漢で流行っているウイルスは東京のとすこし違う 現在のqPCR検査では見分けられないので、ウイルスのシークエンスデータがもっとほしい pic.twitter.com/Z4UwzoIDVF
2020-02-28 18:36:15論文も更新されました Phylogenetic analyses of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reflected the several routes of introduction to Taiwan, the United States, and Japan arxiv.org/abs/2002.08802
2020-03-02 10:19:25外群を加えて系統樹を描き直しました Phylogenetic analyses of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reflected the several routes of introduction to Taiwan, the United States, and Japan arxiv.org/abs/2002.08802
2020-03-02 10:20:20On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2 academic.oup.com/nsr/advance-ar… 中国で論文がでました。やはりC28144Tですね。
2020-03-05 00:39:09この3月3日の中国の論文で述べられているL typeは弊社論文で2月20日に指摘したCTC groupと一致し、同S typeはTCC, TCT groupと同一のものです。 ウイルスゲノム28144番目の塩基がCからTになることによって、アミノ酸配列がセリン(S)からロイシン(L)になります。 twitter.com/info_nbd/statu…
2020-03-05 00:46:53@shizu_fuji_fuji @smith796000 いえ、中国の論文には問題が多数あります。下記をご覧ください virological.org/t/response-to-…
2020-03-07 19:57:10