株式会社日本バイオデータさんによる分析結果「新型コロナウイルスは日本に何回も侵入している可能性」(2020.2.21作成)

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日付切取線 @krtr_date

✄------------ 2/17(月) -----------✄

2020-02-17 00:00:01
日本バイオデータ @info_nbd

系統解析をすると、たぶん新型コロナウイルスは日本に何回も来てる pic.twitter.com/0ZfJtU41Fx

2020-02-17 17:32:55
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✄------------ 2/19(水) -----------✄

2020-02-19 00:00:01
日本バイオデータ @info_nbd

解析を進めました。Parsimony-informative sites だけで眺めると、ReferenceとしたSARS-Cov-2ゲノム(Accession No.MN908947)の8782番塩基(C/T)と28144番塩基(T/C)と29095番塩基(C/T)が重要そうでした。そこで、CTC, TCC, TCTの3グループにわけて作図しました。 pic.twitter.com/I7aXJOia9i

2020-02-19 11:47:37
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日本バイオデータ @info_nbd

詳細については昨夜bioRxivにsubmitしたのでそのうち公開されるとは思いますが、ひとまずそれまではここに置いておきます。 med-mec.com/data/20200219_…

2020-02-19 11:51:48
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✄------------ 2/21(金) -----------✄

2020-02-21 00:00:01
日本バイオデータ @info_nbd

会社のひとがQ&Aをつくってくれました pic.twitter.com/k2uV6Kazkl

2020-02-21 09:54:15
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日本バイオデータ @info_nbd

arXivで論文が公開されました arxiv.org/abs/2002.08802 塩基配列データは下記リンクにあります med-mec.com/data/all.parsn…

2020-02-21 10:57:11
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✄------------ 2/28(金) -----------✄

2020-02-28 00:00:00
日本バイオデータ @info_nbd

系統樹がきれいになってCTCグループの位置がはっきりしてきたので、更新します

2020-02-28 18:35:40
日本バイオデータ @info_nbd

武漢で流行っているウイルスは東京のとすこし違う 現在のqPCR検査では見分けられないので、ウイルスのシークエンスデータがもっとほしい pic.twitter.com/Z4UwzoIDVF

2020-02-28 18:36:15
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✄------------ 2/29(土) -----------✄

2020-02-29 00:00:00
日本バイオデータ @info_nbd

新型コロナウイルスゲノム解析をgithubにまとめました github.com/Hikoyu/SARS-Co…

2020-02-29 08:30:17
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✄------------ 3/2(月) ------------✄

2020-03-02 00:00:01
日本バイオデータ @info_nbd

論文も更新されました Phylogenetic analyses of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reflected the several routes of introduction to Taiwan, the United States, and Japan arxiv.org/abs/2002.08802

2020-03-02 10:19:25
日本バイオデータ @info_nbd

外群を加えて系統樹を描き直しました Phylogenetic analyses of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 reflected the several routes of introduction to Taiwan, the United States, and Japan arxiv.org/abs/2002.08802

2020-03-02 10:20:20
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✄------------ 3/5(木) ------------✄

2020-03-05 00:00:01
日本バイオデータ @info_nbd

On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2 academic.oup.com/nsr/advance-ar… 中国で論文がでました。やはりC28144Tですね。

2020-03-05 00:39:09
日本バイオデータ @info_nbd

この3月3日の中国の論文で述べられているL typeは弊社論文で2月20日に指摘したCTC groupと一致し、同S typeはTCC, TCT groupと同一のものです。 ウイルスゲノム28144番目の塩基がCからTになることによって、アミノ酸配列がセリン(S)からロイシン(L)になります。 twitter.com/info_nbd/statu…

2020-03-05 00:46:53
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✄------------ 3/7(土) ------------✄

2020-03-07 00:00:01
日本バイオデータ @info_nbd

@shizu_fuji_fuji @smith796000 いえ、中国の論文には問題が多数あります。下記をご覧ください virological.org/t/response-to-…

2020-03-07 19:57:10