コロナ関連で読んだ論文等

Nature Medicine @NatureMedicine

New results indicate that surgical face masks could prevent transmission of human #coronavirus (and #flu) from symptomatic individuals - Read now: go.nature.com/2UCvbVM @bencowling88 @HKUniversity #COVID19 pic.twitter.com/QPFg32F9m3

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ヨートゥーン @jotun82

へえ、面白い。ライノにはあまり効果なくて、インフルにはそこそこ効果があって、コロナにはかなり効果があるのか。

ヨートゥーン @jotun82

例のマスク論文、口から（マスクなしorマスクありで）出た飛沫とエアロゾル内にウイルスがいたかどうかというやり方のようだ。

ヨートゥーン @jotun82

「マスクをすると飛沫が出ない」なら分かりやすいが、「マスクをしても飛沫は出るがウイルスはいない」というのはなぜなんだろう。

ヨートゥーン @jotun82

「サージカルマスクは直径5μmまでの粒子を除去することができますが、細菌の大きさは約1μm、ウイルスは0.02～0.1μm程度のため、…通過してしまいます。しかし、咳やくしゃみで飛散する際には、粒子の周りに水分を含んだ直径約5μmの飛沫となっているため…」 med.saraya.com/kansen/ppe/kai…

ヨートゥーン @jotun82

あー、感染部位が上気道だと飛沫が大きくなるけど、下気道だと小さいみたいな関係があるのかな。

ヨートゥーン @jotun82

へえ。 square.umin.ac.jp/fittest/pdf/ft… pic.twitter.com/4eC4dPtiTQ

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ヨートゥーン @jotun82

なんで飛沫核感染する病原体と飛沫感染のみの病原体がいるか、よくわかってないようだが、末梢気道に定着する病原体は入る時も出る時も微粒子を形成しやすいようだ。 sciencedirect.com/science/articl…

ヨートゥーン @jotun82

変異により感染力が大きく変わるとしたら、侵入時に足がかりにする蛋白が変わるとかだろうが、さすがにそこまでの変異は短期間に起こらないのでは。

ヨートゥーン @jotun82

コロナウイルスの細胞侵入機構：病原性発現との関連 jsv.umin.jp/journal/v56-2p…

ヨートゥーン @jotun82

コロナウイルスの細胞侵入機構 jsv.umin.jp/journal/v59-2p…

ヨートゥーン @jotun82

コロナウイルス内でも足がかりにする蛋白はバリエーションがあるようだ。

ヨートゥーン @jotun82

同じベータコロナウイルス属で風邪症状を引き起こすOC43はNeu5Acなのね。インフルエンザみたいだな。

ヨートゥーン @jotun82

Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P… pic.twitter.com/rT0yP0E60M

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ヨートゥーン @jotun82

糖に結合するウイルスの場合、変異によって結合する糖の構造が微妙に変わることはあるかもしれんが、蛋白に結合するウイルスで結合する蛋白が変わるというのはなさそうに思える。

ヨートゥーン @jotun82

On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2 academic.oup.com/nsr/advance-ar…

ヨートゥーン @jotun82

Genome Composition and Divergence of the Novel Coronavirus (2019-nCoV) Originating in China cell.com/action/showPdf…

ヨートゥーン @jotun82

例のS型L型は、どういう蛋白の違いなのかね。

ヨートゥーン @jotun82

「一方で，これらの論文が報告した変異（L型）については、初期に獲得された変異であるので，創始者効果と遺伝的浮動によって広がったのに過ぎないという意見もある（virological.org/t/response-to-…）．そして，武漢市の死亡率の高さについては，重症患者に対する集中的な治療ができなくなってしまった…」

ヨートゥーン @jotun82

Genomic characterization of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan tandfonline.com/doi/full/10.10…

ヨートゥーン @jotun82

"An aggregation motif VLVVL (amino acid 75–79) has been found in SARS-CoV orf8b (Figure 5(B)) which was shown to trigger intracellular stress pathways and activates NLRP3 inflammasomes, but this is absent in this novel orf8 of 2019-nCoV. "

ヨートゥーン @jotun82

変異のある蛋白は機能がよくわかってないようだ。

ヨートゥーン @jotun82

自分としてはあまり新しい情報がなかったけど、これからコロナの基礎的な話を仕入れたい人には、例の実験医学の記事は割とよいと思う。（ただし会員登録が必要。あとパスワードの強度にうるさい） yodosha.co.jp/jikkenigaku/sp…

ヨートゥーン @jotun82

Epidemiological Tools that Predict Partial Herd Immunity to SARS Coronavirus 2 medrxiv.org/content/10.110…

ヨートゥーン @jotun82

まぁ大した内容ではないな。