【論文】重度のCOVID-19の主要な遺伝的危険因子はネアンデルタール人から受け継がれています(2020.10.1作成)

3
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

Covid-19重症化の遺伝的危険因子が見つかる。ネアンデルタール由来で、東アジア人はほとんどが持たない。ーー今日発表のネイチャー論文 nature.com/articles/s4158…

2020-10-01 01:03:27
リンク Nature The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neanderthals A recent genetic association study1 identified a gene cluster on chromosome 3 as a risk locus for respiratory failure upon SARS-CoV-2 infection. A new study2 comprising 3,199 hospitalized COVID-19 patients and controls finds that this is the major genetic 12 users 600
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

論文の図3。この因子を持つ人の比率。インドやばい。 pic.twitter.com/3Vf7NRZ0tr

2020-10-01 01:08:57
拡大
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

一番多いのは、バングラデシュ人の63%がこの因子を持っており、イギリスにおいてバングラデシュ系の人の死亡率は一般の倍。(論文より)

2020-10-01 01:33:53
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

よく読むとこの因子の発見自体は6月発表のNEJM論文 doi.org/10.1056/NEJMoa… で、今回のネイチャー論文ではその因子がネアンデルタール由来であることを突き止め、その因子のある領域についてのもっと以前の調査から図3のように分布がわかったということらしい。

2020-10-01 02:10:22
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

この因子を持っていると入院が必要になる確率が1.6倍になるということのようだ。日本でもたくさん死んでるし、これだけで重症化が決まるわけではないのは言うまでもないので念のため。

2020-10-01 03:00:34
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

繰り返すが、この因子を持たなければ重症化しないという話では全然ないので。 1.6倍の違いを大きいと見るか小さいと見るかだが、一つの遺伝的因子だけで1.6倍は大きく感じる。

2020-10-01 03:09:33
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

それと、人類の祖先がネアンデルタールというほどの話ではなくて、人類とネアンデルタールは過去に一部混血化したということで、これはよく知られている。

2020-10-01 03:14:14
ɐʍɐʞıɥsı ıɥsoɹıɥ @picocog

反応を見ていると結構誤解を招いていそうなので少し解説を加えた。自分も素人だが理系の常識の範囲で。

2020-10-01 03:16:34
kmiura @kmiura

ペーボのラボからすごい論文。「なぞなぞ効果(©コロラド先生)」のなぞが解けた、という感じである。 twitter.com/picocog/status…

2020-10-01 08:45:17
kmiura @kmiura

ペーボは私の院生時代の研究所の気さくな若手教授で、隣のビアガーデンに一緒にいったりしてた。その後ノーベル賞とったんでちとびっくりであったが、今沖縄にいるのか... それにしてもおもろい論文。ネイチャーらしい論文である。

2020-10-01 08:53:57
kmiura @kmiura

ネアンデルタールのハロタイプ 南アジア 30% ヨーロッパ 8% アメリカ 4% 東アジア 4%より少ない。 バングラディッシュはなんと63%でヤバヤバである。 アフリカ人はほとんどなし。ネアンデルタール人、アフリカ大陸に南下しなかったんだな。

2020-10-01 08:53:57
kmiura @kmiura

東アジアと南アジアでものすごく比率が違うのは、たんに私見だが東アジアではネアンデルタール系を虐殺したんじゃないだろうか。たとえば大和朝廷である。

2020-10-01 08:53:58
kmiura @kmiura

インドやインドネシアの感染者数が非常にやばいことになっている理由はこれかー。

2020-10-01 08:57:00
kmiura @kmiura

となると米国の盛大な状況はコンシステントではないが。

2020-10-01 08:58:00
kmiura @kmiura

ビールを飲みながら話してたときのことを今思い出したが、私がなんかのはずみに人類アフリカ起源説の話をしたら「私に向かってそんなこというのか!違うってさんざん論文かいてるんだぞ!」とマジになっていうんで恐れ入ったのであった... 今回の論文はその続きでもある。

2020-10-01 09:05:53
kmiura @kmiura

ちなみに論文の仮説は疫病によるセレクション。ずっと昔に東アジアで新コロみたいなウィルスがはやってネアンデルタール系はほぼ絶滅、という仮説。一方でバングラディッシュでは逆に別のウィルスでネアンデルタール系が残ったのではないか、という。 pic.twitter.com/rpCReBTsxT

2020-10-01 09:11:32
拡大
kmiura @kmiura

あ。進化論の場合は「選択」ではなく「淘汰」とかだな

2020-10-01 09:12:38
kmiura @kmiura

ネアンデルタールのハロタイプの分布 pic.twitter.com/ueY3V6QSRe

2020-10-01 09:19:05
拡大
内田 @uchida_kawasaki

ネアンデルタール人の遺伝子、コロナ重症化に関与か 研究 afpbb.com/articles/-/330… @afpbbcomから

2020-10-01 19:19:33
リンク www.afpbb.com ネアンデルタール人の遺伝子、コロナ重症化に関与か 研究 【10月1日 AFP】約6万年前にヒトゲノムに挿入されたネアンデルタール人(Neanderthal)の遺伝子の断片が、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の重症化リスクを高めることが分かったとする研究報告が9月30日、英科学誌ネイチャー(Nature)電子版に発表された。 31 users 297
内田 @uchida_kawasaki

感染症:COVID-19重症化の遺伝的リスク因子はネアンデルタール人から受け継いだと考えられる | Nature | Nature Research: natureasia.com/ja-jp/nature/p…

2020-10-02 06:03:02
内田 @uchida_kawasaki

OIST【プレスリリース】新型コロナの重症化はネアンデルタール人から受け継いだ | 日本の研究.com research-er.jp/articles/view/…

2020-10-02 06:17:08
リンク 日本の研究.com 【プレスリリース】新型コロナの重症化はネアンデルタール人から受け継いだ | 日本の研究.com 2020.09.30 沖縄科学技術大学院大学 プレスリリース 新型ウイルスSARS-CoV-2は、2019年末に初めて確認されてから、感染した人々にさまざまな影響を与えています。このウイルスが引き起こす新型コロナウイルス感染症(COVID-19)を発症すると、重症化して入院が必要になる人がいる一方で... 3 users 358