新型コロナの変異株の名前の由来、英国の役割、PCRとゲノムのこと

新型コロナの変異株の名前の由来についてまとめ。変異株の発見における英国の役割。PCRとゲノムのこと等。
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MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

変異株の名前の由来について、調べて分かったことを、書きました。 note:「新型コロナの変異株の名前について」 note.com/mizuno_yoshiyu…

2021-01-03 11:02:15
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

英国は1980年代、サッチャー首相の時代からいよいよ大英帝国に陰りがみえ(日本はバブル期で)、新自由主義、教育改革など大手術を行った。高エネルギー物理学など基礎科学も削減。ひどく心配したものだ。しかし驚くことに、生命科学は遺伝子解析など世界一らしい。何がどう、世界を救うか分からない。

2021-01-03 11:33:16
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

今回の新型コロナ変異株だって、全ゲノム解析がないと、分からなかった。英国があって世界は救われた。このデータは世界で30万件、英国だけで約15万件。日本は1.4万件で英国の1/10程度。 「変異種、なぜ英国で? 大規模解析でいち早くキャッチ」下司佳代子、2020年12月26日 digital.asahi.com/articles/ASNDV…

2021-01-03 11:45:49
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

今年の大学入試「生物」は、ほぼ確実にPCRが出る。PCRは高校の教科書に詳しく説明されている。そのPCRは、全ゲノム系列の一部だけを増幅して検出している。しかしそれだけでは変異株どうか判定できない。全ゲノム解析された世界のデータ30万件は、データベース化され、変異が常時ウォッチされている。

2021-01-03 12:05:58
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

ゲノムや遺伝子について。DNAは分子の名前。その系列の一部に遺伝子(生体物質の設計図)がある。例えばお酒に強いかどうかを決める遺伝子は12番染色体の下半分の一部にあり、ALDH2(アルデヒド・デヒドロナーゼ2)と呼ばれ、アルコールを消化・酸化して出来るアルデヒドの分解酵素の設計図と言う具合。

2021-01-03 12:22:35
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

ゲノムと遺伝子ってどう違うか。意味がある遺伝子系列の全部の全部を総称して、ゲノムと呼ぶ。ゲノム(genome) = gene(遺伝子) + choromosome(染色体)という合成語。だから一見、意味不明だが理解は必要。ヒトのゲノムマップが「一家に1枚」に出ていて分かりやすい。 stw.mext.go.jp/common/pdf/ser…

2021-01-03 12:34:35
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

失礼、これの一部にタイプミスあり。自明ですが、choromosome(染色体)ではなく、chromosome(染色体)。 なお、chromo=色という意味。アクロマティックレンズ(色収差を消すレンズ)とかQuantumChromoDynamics(量子色力学)とか。 some=何何体の体、全体という意味。somatic cellで体細胞とか。

2021-01-04 01:23:15
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

ヒトの遺伝子は2万種類くらいあると思っている方も多いと思うが、調べてみると、何と毎年毎年増加していて、驚かされる。 (以上) pic.twitter.com/XJX2fNF19z

2021-01-03 12:42:54
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G-quad @Crane_MolTech

ほぇー、今の高校の生物の教科書にはPCRが記載されてるんだ。 因みに僕は90年代中盤に修士で菌ゲノムをやってました。 twitter.com/y_mizuno/statu…

2021-01-03 12:19:57
ピッピ @piropiropo_

@y_mizuno そういえば日本のゲノム解析って全感染者の 10%程度ってどこかで見ました それ以上は予算・人手から出来ないようです

2021-01-03 11:58:27
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

@piropiropo_ それくらいらしいですね。でも英国でも割合としては10%程度だそうです。まぁ、数が違うので、その意味では同じ10%でもだいぶ、意味が異なりますが。

2021-01-03 12:07:41
ぽんたしろお @y4K2EYd10UCUVrt

変異株の名付け方に関する記事。 一回読んでおくといいかもって思う。 twitter.com/y_mizuno/statu…

2021-01-03 12:42:43
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

@0crOZum6EhxMPx1 そのようですね。 仮に、変異株が英国以外で発生していたら、もっと発見が遅れたのではないか(気付くまでに、広がってしまって、世界中が対応に苦慮したのではないか)、という気がします。 しかし、今後、仮に(英国のように)この株に遷移していくなら、さらに抑えるのが困難になるのが悩み。。。

2021-01-03 13:27:46
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

そのようです。(でもこれが広がってしまえば、元も子もないものの、時間稼ぎにはなったことは確かかとは思えます。) twitter.com/hachiya/status…

2021-01-03 17:38:44
八谷和彦 @hachiya

なるほど。変異株は英国発祥、というより「大規模解析をしていた英国だからこそいちはやく発見できた」というのが正しいのか。 twitter.com/y_mizuno/statu…

2021-01-03 17:17:38
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

@kabochano そこ(流入対策)は、英国も歓迎だと思います。(まさにグローバルな事象だし、他に方法がないでしょうし。)

2021-01-03 18:10:16
MIZUNO Yoshiyuki 水野義之 @y_mizuno

ありがとうございます。(まさにそういう意図で書きました。) twitter.com/y4K2EYd10UCUVr…

2021-01-03 12:45:10