ゲル切り出しの染色方法と制限酵素使用の注意点

あとで見るためのメモ用。
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Tea gondii @tea_gondii

キレたベクターをagarose gel流して、切り出す時、gel redで、UV照射なのだが、mutation怖いのです。メチレンブルーで染めれるみたいなのだが、誰かやったことある方いないでしょうか?

2011-09-07 08:52:43
薄切りバウム @Usugiri_Baum

UVの波長は変えられますか?310nm以上ならほぼ問題ないという経験ですよ RT @teatimest: キレたベクターをagarose gel流して、切り出す時、gel redで、UV照射なのだが、mutation怖いのです。

2011-09-07 08:59:05
Tea gondii @tea_gondii

そうなんですか。明日調べてみます。ありがとう! QT @Usugiri_Baum: UVの波長は変えられますか?310nm以上ならほぼ問題ないという経験ですよ RT @teatimest: キレたベクターをagarose gel流して、切り出す時、gel redで、UV照射な

2011-09-07 09:00:50
ima3 @timasaki

@teatimest 目を凝らすと視えるはずw (uso)

2011-09-07 09:09:50
Tea gondii @tea_gondii

SYBR safe使ってる?ethidium bromide? methylene blue? gel red? QT @timasaki: @teatimest 目を凝らすと視えるはずw (uso)

2011-09-07 09:13:59
ima3 @timasaki

@teatimest ふつうに ethidium bromide ですw (ホント)

2011-09-07 09:14:42
Ms. Mango @spikeyspikier

@teatimest 私もUVの当てすぎが怖いので、2レーン用意してます(メチレンブルーじゃなくてすみません)。UV当てるレーン(サイズ確認用)と当てないレーン(切り出し用)で、当てないレーンはアルミホイルでくるんでます。

2011-09-07 09:14:47
ろん3りーまん @YHinLondon

@timasaki @teatimest 日本人なら心眼でDNAをゲルから切り出せますw

2011-09-07 09:15:07
Tea gondii @tea_gondii

お、なるほど。そういう手があったのですね。 QT @Edamgirl: 私もUVの当てすぎが怖いので、2レーン用意してます(メチレンブルーじゃなくてすみません)。UV当てるレーン(サイズ確認用)と当てないレーン(切り出し用)で、当てないレーンはアルミホイルでくるんでます。

2011-09-07 09:17:12
Tea gondii @tea_gondii

修行がまだまだ足りませんのです。 QT @YHinLondon: @timasaki @teatimest 日本人なら心眼でDNAをゲルから切り出せますw

2011-09-07 09:17:50
Ms. Mango @spikeyspikier

@teatimest すみません、mutationの意味をgelに入ってる方のDNAのmutationだと思って返信してしまいました。私も普通にエチブロ使ってます。

2011-09-07 09:19:09
Tea gondii @tea_gondii

青いgel boxあるのですね。青い懐中電灯でなんとかならないかなと考えてたのですが。 QT @YHinLondon: @teatimest うちはSYBR safe使ってます。

2011-09-07 09:19:13
Yuki @yukidepon

@teatimest UV当てて切り出してますよ。照射時間は出来るだけ少なくなるようにしますが。少しくらいなら直ちにDNAに損傷を及ぼすことはないかと(健康被害みたいな言い回しw)「照射→撮影→OFF→照射→ゲルカット→切る→落ち着いて回収」僕の場合は照射は数秒程度っす

2011-09-07 09:21:20
Tea gondii @tea_gondii

ええ、あってると思います。切り出し時、UVでmutation起こらないかいつもハラハラドキドキなのです。 QT @Edamgirl: @teatimest すみません、mutationの意味をgelに入ってる方のDNAのmutationだと思って返信してしまいました。私も普通にエ

2011-09-07 09:21:35
ろん3りーまん @YHinLondon

@teatimest SYBRの量を多めに入れると蛍光灯の光でバンドが見えますw もちろんDNAの量が多ければですがw

2011-09-07 09:22:39
Tea gondii @tea_gondii

凄い、数秒なんて、素早いのですね。 QT @yukidepon: @teatimest UV当てて切り出してますよ。僕の場合は照射は数秒程度っす

2011-09-07 09:25:20
Ms. Mango @spikeyspikier

@teatimest 私もハラハラしてます。特にきれいなゲル写真を撮ろうとすると色々こだわって照射時間が長くなりませんかw?私は2レーン用意するようになってからコロニー数がましになりました。

2011-09-07 09:27:17
Tea gondii @tea_gondii

そういえば、gel redも、たくさん入れれば白光でも見えるって聞いたことが、、、。 QT @YHinLondon: @teatimest SYBRの量を多めに入れると蛍光灯の光でバンドが見えますw もちろんDNAの量が多ければですがw

2011-09-07 09:27:54
Tea gondii @tea_gondii

ええ、なるべくゲルの体積減らそうとするので、さらに長くなったり。 QT @Edamgirl: @teatimest 私もハラハラしてます。特にきれいなゲル写真を撮ろうとすると色々こだわって照射時間が長くなりませんかw?私は2レーン用意するようになってからコロニー数がましになりまし

2011-09-07 09:29:43
薄切りバウム @Usugiri_Baum

@teatimest @yukidepon UV当ててるときは目印付けるだけにしてます。初心者院生もこれで成功率アップしてるのでオススメです☆

2011-09-07 09:31:48
ima3 @timasaki

@teatimest マジレスすると私もたくさん当てるの嫌なので写真取る用途切り出し用は分けています。切り出すときは UV 当てるの5秒程度 @Edamgirl

2011-09-07 09:32:39
ε(ミミ ๑・ิ 』・ิ๑ )💙💛🕊モモフモフ💉𖤣𖥧𖥣。 @edamame0811

@teatimest Johnのところにblue boxあるぉ。EtBrも見える。mutationでなくてnick…あったら増えてこないからそういう心配はしなくていいのではない?w 収量は下がるケドw

2011-09-07 09:33:02
Tea gondii @tea_gondii

おお、ゲルに目印付けて、白光で切るのですか?なかなか高等テクニック。 QT @Usugiri_Baum: @teatimest @yukidepon UV当ててるときは目印付けるだけにしてます。初心者院生もこれで成功率アップしてるのでオススメです☆

2011-09-07 09:36:53
薄切りバウム @Usugiri_Baum

@teatimest @yukidepon 僕は目印法を使わないとUVは数秒以内なんていう神業は無理なのでw

2011-09-07 09:39:38
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