分子系統学の理論と実習
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Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 全ゲノム情報を用いてグローバルに系統推定するから「不確定性」が生じるのであって，ローカルなクレードごとに別々の情報（種分化遺伝子みたいなもの）に基づくバックポーンを固定したうえで，グローバルな系統樹を組み上げるというアプローチがある（TMR師談）．
2011-10-26 16:02:42
Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 （承前）全生物の系統推定と言った時点で使用できるオルソローグは狭くかぎられてしまうから．
2011-10-26 16:04:54
Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 ワークショップ初日だん！ みなさん，おつ〜．さあ交流会だー．うらーっ！
2011-10-26 17:09:52
K.Ooi
@k_ooi
宿泊棟のルールに従い22時で2次会もお開き。いろいろな方と交流できて有意義でした。明日も1日レクチャーがあります。またよろしく。 #tbh155
2011-10-26 22:32:30
Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 将来的に MEGAに Bayesian MCMC が入る可能性もあるらしい．TMR師談．
2011-10-27 05:26:31
Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 （承前）BGH センセがそれを強く強く望んでいるらしい．第五版ではそうなるのかな．
2011-10-27 05:30:31
白水 貴
@Takashirouzu
おお！次回マルチコア解析が実装されるという以上の衝撃！RT @leeswijzer: #tbh155 将来的に MEGAに Bayesian MCMC が入る可能性もあるらしい．TMR師談．
2011-10-27 07:34:23
白水 貴
@Takashirouzu
セミナー室の外に系統解析に関する参考文献が並んでいる．欲しいものがちらほらあるが，特にPhylogenetic Handbookが気になる．系統解析ソフトの開発者達が書いたマニュアル本．#tbh155
2011-10-28 08:38:46
Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 分子系統ワークショップの最終日．会場なう．外はよく晴れて快適な秋晴れ．今朝の最低気温は5.4度まで下がったが，いまは10度を越えている．朝イチの講義は三島からSaitou画伯をお迎えしての系統ネットワーク高座なのだが，御大のお姿がまだ見当たらない……．
2011-10-28 08:44:38
Minaka Nobuhiro 〈みなか食堂〉店主
@leeswijzer
#tbh155 系統ネットワークはスタティックだから，進化モデルを前提とする最尤法を適用するのはそもそもまちがいである．「最尤ネットワーク」は原理的にありえない．
2011-10-28 10:05:45