質量分析に詳しいお兄さんたちに相談してみた

どうしても検出できない修飾ペプチドについて頼りになるお兄さんたちに相談させてもらった記録です。
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Yuki @yukidepon

先生、セルソーターが欲しいです

2012-06-26 19:22:55
Yuki @yukidepon

あ、コンフォーカルとSEMも←

2012-06-26 19:23:17
Yuki @yukidepon

いやむしろコンフォーカルが最重要

2012-06-26 19:24:23
tomomih @tomomih

まるでとふください

2012-06-26 19:24:42
Yuki @yukidepon

@tomomih まるでとふは(ほぼ)一価のイオンなので見た目的にもとても分かり易くて好きです

2012-06-26 19:28:26
tomomih @tomomih

@yukidepon ESIでうまく拾えないペプチドに遭遇してしまいまして。まるでならいけるのかなぁ…なんてw でも古い島津で試す元気はないw

2012-06-26 19:35:05
Yuki @yukidepon

@tomomih あーそれはありますねぇ。もちろんMALDIで拾いにくくてESIで拾いやすいモノとかもありますが。 ペプチドに修飾かかってたりするとMADLIの方が楽なのかなーとか思います(なんとなく思うだけw

2012-06-26 19:37:04
tomomih @tomomih

@yukidepon うああああそのペプチド修飾なんですぅ…orz 古巣にも相談しようかなぁ。古いはずだけどw

2012-06-26 19:39:09
tomomih @tomomih

ぜっっったいくっついてるのに出なくてね。ないわけないだろコラーとかいいながら過ごす日々。ぐぬぬぬぬ。

2012-06-26 19:41:00
Yuki @yukidepon

@tomomih MALDIでもリニアモードなら検出できるけどリフレクターで跳ね返すと取れちゃう修飾なんてのもあるのでリニア検出器がくっついているやつの方がいいかもです(例:リン酸基、シアル酸など)

2012-06-26 19:44:09
tomomih @tomomih

@yukidepon ありがとうございますめもめも。うちの古いのと古巣の古いのがどうなってたか確認しますw いかんせんMALDI触ったこともないのでw

2012-06-26 19:48:17
まるでとうふ @MALDITOF

た、食べ物ではございません・・・ "@tomomih: まるでとふください"

2012-06-26 19:48:19
Yuki @yukidepon

@MALDITOF @tomomih こんなに身近にプロフェッショナルがいるではないですかw 丸泥さんが相談相手の適任すぎて涙がでたw

2012-06-26 19:49:54
tomomih @tomomih

@yukidepon @MALDITOF うちは古い島津、古巣も古い島津なんじゃないかなと…。丸泥さんに頼る以前の問題かもしれないですorz

2012-06-26 19:52:23
Yuki @yukidepon

@tomomih @MALDITOF 低分子追っかけてたのでしたっけ?ペプチドとか蛋白だったりしたらまた装置の相性があるのかなーとは思いますが

2012-06-26 19:54:35
tomomih @tomomih

@yukidepon @MALDITOF 新しく預かったサンプルなんですがね。タンパクのリジン残基が新規物質で蛍光修飾してあるのです。PAGEでみるとちゃんと光ってて。それ消化してESIおるびたんにかけて修飾ペプチド探したんですが…。つるっと無修飾なペプチドしか出なくってorz

2012-06-26 19:59:18
tomomih @tomomih

@yukidepon @MALDITOF 同じような方法で他の低分子は見れたんですがねぇ。消化酵素変えたり、リン酸化みたいにニュートラルロスで検索してもあぼんな現在です。似たようなことしてる論文を良く読んで、みなさんどうしてるか調べないとダメですかねぇ

2012-06-26 20:02:49
Yuki @yukidepon

@tomomih @MALDITOF ペプチド修飾ならやっぱしリニアモードのMALDIが楽なんじゃないかなぁ。つるっと無修飾、語呂にわろたw

2012-06-26 20:06:32
tomomih @tomomih

@yukidepon @MALDITOF おるびたんで変なこと(ネガティブまではやった、電圧変えまくりはまだ)するより早そうですよねぇ。まるでとふ欲しいw 取り急ぎ使えるとこないか探しますw

2012-06-26 20:09:40
Yuki @yukidepon

@tomomih @MALDITOF シマズの古いやつでトバしてみるのも手じゃないかなとも思いますよ。DHBかCHCAと混ぜてスポットするだけで簡単だし試料調整はESI使われているので特にハードルはないだろうし

2012-06-26 20:12:27
tomomih @tomomih

古巣でも医学部にはありそうだが…。ちょっとコワイ。

2012-06-26 20:12:34
tomomih @tomomih

あ、あとあの大学さんは相談できるかも。

2012-06-26 20:13:00
tomomih @tomomih

ボスに頼もうそうしよう。

2012-06-26 20:13:04
tomomih @tomomih

@yukidepon @MALDITOF そうですね、島津も壊れてるわけじゃないので試せますたぶん。依頼元の期待に応えたいですし、何とかやってみます ( • ̀ω•́ )✧

2012-06-26 20:16:00
Yuki @yukidepon

@tomomih @MALDITOF 試薬とか調製とかで悩んだらまたその都度と言うことで( • ̀ω•́ )✧

2012-06-26 20:18:15
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