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生命情報若手の会 day2 (2010)

ハッシュタグbioinfowakateをそのまま載せました。追加削除するべきpostをご存知の方は編集よろしくお願いします。
生命情報若手
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猫じゃら美少女 @tonets
10時くらいからひたすら夜の討論会done. 楽しすぎた。 #bioinfowakate
猫じゃら美少女 @tonets
話題はNGSeqを中心に日本の100年後の未来まで。若手研究者の夢と希望に溢れた討論会であったように思う。 #bioinfowakate
猫じゃら美少女 @tonets
エラい人達の言う10万人ゲノムコホート計画にも言及。日本でやるにはあまりにも施設と人材が足りない。 #bioinfowakate
猫じゃら美少女 @tonets
ゲノムが安価に読めたら、あなたは自分のゲノムを見たいですか? という個人的情報開示から、髪の毛1本からでもゲノムが読めるのが当たり前になった時代のゲノム情報の扱いまで。 #bioinfowakate
猫じゃら美少女 @tonets
というわけでおはようございます #bioinfowakate
So Nakagawa @sounaka
みなさまおはようございます、今日もよろしくお願いします! #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
全体では午前3時まで歓談していました。一部の人は4時までやっていた模様。昼の部の面白さはもちろんですが、若手の会は(も?)やっぱり夜の部の盛り上がりが最高。こちらはtsudaりませんので、興味ある方は次回参加してください:) #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
と思いきや、@tonetsさんは多少tweetしている!!さすがです:) #bioinfowakate
猫じゃら美少女 @tonets
ネットがつながらないのでじくついから #bioinfowakate
Thanet Praneenararat @fiboknacky
นั่งฟังบรรยายอยู่ที่งานประชุม นักวิจัยไบโออินโฟ รุ่นเยาว์ #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
東北大・大林さん: 遺伝子共発現データの比較を利用した遺伝子機能の網羅的推定。ロゴ外注の話が終わったら「あと5分です」 #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
植物では共発現と組み合わせるとターゲットを絞りやすい方法としては、まずはファミリーでわけること、らしい。ということはGOとかでフィルタリングするとやりやすいということかな?そういうオプションはあってもいいのかも。(既にあるのかもだけど) #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
農生研・三原さん:アミノ酸配列の保存モチーフパターンによるクラスタリングとSALAD databaseの作成。MEMEでモチーフを抽出して、そのパターンでホモロググループをクラスタリング。詳細なオーソログ・パラログの解析に非常によさげ。 #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
基生研・佐藤さん:シグナル伝達ネットワークモデリングによって明らかになった 植物免疫システム構造 – スイッチ型シグナル伝達と想定される意思決定機構。変異体のアレーから制御ネットワークを推定。 #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
次座長なので誰かtsudaりかわって〜 #bioinfowakate
Wataru IWASAKI @iwasakiw
東大・Praneenararatくん:超高速グラフクラスタリングを用いた,巨大ネットワークをインタラクティブかつマルチスケールにナビゲーションする手法の開発. #bioinfowakate
Wataru IWASAKI @iwasakiw
慶応大・斉藤さん:転写されているRNAの中には相同性検索にかからないものが多い(例えば機能性RNAのファミリーにあたる「clan」など).BPLAカーネルを使ってデータベースから2次構造のインデックスを作成しておき,入力配列を2次構造予測し高速検索. #bioinfowakate
@bioinfo_tanakky
@iwasakiw Although I can not attend Wakate-kai today, tweets with #bioinfowakate tag are helpful!!! Thank you!
Wataru IWASAKI @iwasakiw
慶応大・ポペンドフさん:MURASAKIは9哺乳類ゲノムを48分でアラインメント.工夫はアンカーにSpaced Seedsを用い,かつエントロピーの高いハッシュ関数を遺伝的アルゴリズムを使って求めること等々.斉藤さんもですが実験結果がとてもきれい. #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
イルミナ:ランチョンセミナー。 #bioinfowakate
Kazuharu Arakawa @gaou_ak
Genome Analyzerを使った累積論文数600超え。HiSeq2000は200Gb(100bp x 2)を8日間で。20億リード。2重構造フローセル(上下)を4台のCCDでラインスキャン。フローセル設置の簡易化、試薬のカートリッジ化。 #bioinfowakate
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コメント

ひろ@猫もふ欠乏症 @hiro_h 2010-10-11 00:57:23
生命情報若手の会 day2 (2010) http://togetter.com/edit/58101 に少しpostを追加しました。
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