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Kozo Nishida @kozo2
一昨日は客室でも無線LANが使えていたが昨日から届かなくなったみたいだ
Kozo Nishida @kozo2
そうかPSICQUICに対応してもらえばそのdatabase専用のclient書かなくてもuniversal clientがあるから全部オッケーなのか
Kozo Nishida @kozo2
@c_z けどSTRINGってPSICQUICにも対応してるけどSTRINGWSclientも自前で作ってたりしますよね。可視化できることの幅に違いがあったりするんでしょうか
Kozo Nishida @kozo2
MetScape今後のタスクにあげてた機能と全く同じこと実現してるな。ソース公開されてないかな...
Keiichiro Ono @c_z
@kozo2 STRINGに関しては、純粋にライセンスの関係だときいています。PSICQUICで公開すれば、レスポンスの時間を考慮しなければ、基本的に根こそぎデータを取ってくるクライアントも書けますので、そこが一部ライセンス的に問題があると。
Keiichiro Ono @c_z
@kozo2 STRINGのデータダウンロードページに行ってもらうと分かりますが、データの種類によって「要問い合わせ」になってるものもあるはずです。
Keiichiro Ono @c_z
オープンソース支持者には、「オープンソースじゃなきゃダメ」派と「オープンソースが多い方が良いよね」派が居ると思うけど、自分は後者だな。Appleの開発環境とかめんどくさいと思うけど、オープンソースのカオスであれが出来たかと言うと微妙で・・・どうしようもないトレードオフなんだろうか
Keiichiro Ono @c_z
Google本社で今週末あるGSoC Mentor Summitでも、統一感のあるUIやユーザビリティーは毎年議論のネタになってる。オープンソースが一番弱いところで、まだ誰も答えを見つけてない部分。
bonohu @bonohu
3日目ゆるゆる開始しています #bh2010
bonohu @bonohu
ラフォーレ修善寺はしとしとと雨です #bh2010
so @synobu
西田孝三(NAIST):「Cytoscapeを用いたデータベースクライアント、可視化」http://bit.ly/d3SFmT #bh2010
Keiichiro Ono @c_z
それはWeb Startを使えば出来ます>ブラウザからCytoscapeを立ち上げる (#bh2010 live at http://ustre.am/fg0g )
Takeshi Obayashi @dancing_infobio
Cytoscape-web is not powerful as stand-alone Cytoscape but ATTED-II network can be shown on it. http://cytoscapeweb.cytoscape.org/ #bh2010
so @synobu
Cytoscape WebのFeature Showcase Demoから、Cytoscape Webの雰囲気は体験できます。http://cytoscapeweb.cytoscape.org/demo #bh2010
so @synobu
Cyotoscapeコア開発者 @c_zさん 降臨! #bh2010
Keiichiro Ono @c_z
マニュアルにも簡単なチュートリアルがあります>VizMapの使い方 (#bh2010 live at http://ustre.am/fg0g )
so @synobu
質問:Cytoscapeでネットワークの統計量計算は出せますか? #bh2010
Keiichiro Ono @c_z
NetworkAnalyzerとCentiScape、RCytoscapeがあります>統計量 (#bh2010 live at http://ustre.am/fg0g )
まこ @ma_ko
Access : Integration of biological networks and gene expression data using Cytoscape : Nature Protocols http://bit.ly/bC16Lp #bh2010
Wataru IWASAKI @iwasakiw
ネットワーク関係のデータベース運営者はCytoscapeプラグインを作るとよい.ただウェットの生物学者にとっては導入が大変で,かといってCytoscape Webでは機能が限られる.Web Start( http://bit.ly/c0OpvW )も使えそう. #bh2010
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