自然史コレクションの保存と活用をすすめる国際学会SPNHC参戦記その1学会本体

2015年5月、フロリダで開催されたSPNHCに参戦してきました。コレクションのマネジメント、デジタル化、保全など日本では学術的に語られることの少ない博物館の要素がてんこ盛りです。http://www.flmnh.ufl.edu/spnhc2015/home/
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sakumad @sakumad2003

始まりました。とりあえず、オーガナイザーたちのご挨拶から。メインプログラム前だけど200ちょっとぐらいの参加者という感じかな。 pic.twitter.com/IHuAEaUg4K

2015-05-19 21:26:53
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sakumad @sakumad2003

メモ。iDigBio Home | 今回のSPNHCのテーマは標本情報へのアクセスをより簡単に、ということなんのだが、それに深く関わる。GBIFのアメリカ版という感じでもあるけど味付けはだいぶ違う感じ。 idigbio.org

2015-05-19 21:33:15
sakumad @sakumad2003

この動きと表裏一体の様子。日本のGBIFにはこうしたところがない、ということかな。Advancing Digitization of Biodiversity Collections (ADBC) (nsf13569) nsf.gov/pubs/2013/nsf1…

2015-05-19 21:34:57
sakumad @sakumad2003

@mothprog 話を聞いてるとそこのアウトプットを備えたデータベース統合という感じ。

2015-05-19 21:42:26
sakumad @sakumad2003

この辺のデータ見てるとアメリカ版GBIFでもあるけど、データの作り方は生態学や形態学を意識した拡張が相当されている感じでもある。大変そうな印象もあるけど全部がそうでもなさそう。ダーウィンコア準拠だし。iDigBio Portal portal.idigbio.org/portal/publish…

2015-05-19 21:48:47
sakumad @sakumad2003

2題目の基調講演はこの本の写真家。博物館所属の写真家など多様な博物館関係職種の人がこの学会を構成している。: Evidence of Evolution : Mary Ellen Hannibal, Susan Middleton amazon.com/Evidence-Evolu…

2015-05-19 22:14:55
sakumad @sakumad2003

Susan Middletonさんの個人サイト。元カリフォルニア科学アカデミーの写真部門トップ。 susanmiddleton.com/Susan_Middleto…

2015-05-19 22:21:28
sakumad @sakumad2003

三題目はこの人。Erin A. Tripp - Assistant Professor; Curator of Botany, COLO Herbarium ebio.colorado.edu/index.php/peop…

2015-05-19 22:23:27
sakumad @sakumad2003

あとで読む。(この話は講演では出ずにサンプリングと標本の重要性の話、それを使ってどんなことができるのかだったけど)特異化は進化の行き止まりなのか? bio-nica.info/biblioteca/Tri…

2015-05-19 22:50:57
sakumad @sakumad2003

メモCitizen Science Association | A community of practice for the field of public participation in scientific research. citizenscienceassociation.org

2015-05-19 23:42:02
リンク fossilinsects.colorado.edu Green River Digitization at the UCM If you’ve been following the Fossil Insect Collaborative through social media or as a participant in the digitization project, chances are you’ve seen examples of the specimens being imaged at the University of Colorado Museum of Natural History (UCM). ..
sakumad @sakumad2003

これも後で見る。Notes from Nature notesfromnature.org

2015-05-19 23:43:27
sakumad @sakumad2003

メモだらけですまん。SPNHCのAustin R. Mast氏の基調講演より。Evolved Science: Crowds Can Catalog Bugs Faster : All Tech Considered : NPR npr.org/sections/allte…

2015-05-19 23:44:47
sakumad @sakumad2003

面白い。画像公開してデータ登録に協力してもらうってか。Reaching Consensus in Crowdsourced Transcription of Biocollections Information | iDigBio idigbio.org/content/reachi…

2015-05-19 23:50:44
sakumad @sakumad2003

ふむ。Accelerating the Digitization of Biodiversity Research Specimens through Online Public Participation bioscience.oxfordjournals.org/content/early/…

2015-05-19 23:52:53
sakumad @sakumad2003

面白そうな動きはたくさんあるな。 | wedigbio.org wedigbio.org

2015-05-20 00:02:16
sakumad @sakumad2003

あとで読む。デジタル化だけでなく市民参加な仕掛けなわけだ。: Public Participation in Scientific Research: a Framework for Deliberate Design ecologyandsociety.org/vol17/iss2/art…

2015-05-20 00:06:46
sakumad @sakumad2003

Sleepless nights: When you can't find anything to use but molecul...: ingentaconnect ingentaconnect.com/content/iapt/t…

2015-05-20 10:10:47
sakumad @sakumad2003

使ったことないけどBiomod2か。分布の話には勉強しとかないといけないかな。 cran.r-project.org/web/packages/b…

2015-05-20 22:10:19
sakumad @sakumad2003

朝のお話はこちらから。もうひとつの会場はまずは大原さんに任せた。 idigbio.org/wiki/images/b/…

2015-05-20 22:18:06
sakumad @sakumad2003

大量のデータを統合して公開するときに、データをどのくらい、どうやって「綺麗にするのか」これを職務として考える人は日本の博物館にどのくらいいるのかを考えちゃう話VertNet-Resources-Datasets-Tools-Code vertnet.org/resources/data…

2015-05-20 22:23:20
sakumad @sakumad2003

VertNetはGBIFやiDigBioに相当データ提供しているところの一つなのだけど、こういうところにNSFのお金がキチンと出ているところが大事だな。(最下段のロゴが光りますなぁ) vertnet.org/index.html

2015-05-20 22:25:40
sakumad @sakumad2003

アメリカの博物館のデータベース事情の面白いところは、iDigBioみたいな一つのとこに集中してるのでなくて、こういう地域のデータベースにかなり投資して、競うようにして改良していることではないかと思う。これはアリゾナの例→SEINet swbiodiversity.org/portal/index.p…

2015-05-20 22:36:26
sakumad @sakumad2003

David Schindelさんのお話。Barcode of lifeの信頼性のためにもどれだけきちんとデジタルドキュメントを綺麗にきちんとしておくかが大事という話が中心。ダーウィンコアの組織、コレクション、標本番号からリンクを作る barcoding.si.edu/PDF/DWG_data_s…

2015-05-20 23:06:35
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