WACODE夏期講習

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もじゃもじゃのほう (Koki Tsuyuzaki) @antiplastics

WACODE 2nd タイトルが充実してきました。まだまだ参加可能ですので、皆さん是非和光にお越しください。 atnd.org/events/68466

2015-08-31 13:16:38
ゲノムのほうの愛ちゃん🌙 🐧 @dritoshi

データ解析、統計、機械学習、プログラミングを活用する現場の人間が理研和光地区に集まり、交流・情報交換を行うイベントです WACODE(わこうど) 2nd : ATND atnd.org/events/68466

2015-08-31 13:51:17
ゲノムのほうの愛ちゃん🌙 🐧 @dritoshi

WACODEがなにものか書かないとクリックしてくれないよ。

2015-08-31 14:17:39
. @chatsuta

WACODE今週末か、悩ましい。

2015-09-01 23:33:25
. @chatsuta

あ、TokyoRとWACODE、同じ日か。

2015-09-02 00:11:38
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

もうすぐ始まります #wacode データ解析、統計、機械学習、プログラミングを活用する現場の人間が理研和光地区に集まり、交流・情報交換を行うイベント WACODE(わこうど) 2nd : ATND atnd.org/events/68466

2015-09-05 12:42:44
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

「カーネル法を利用した異常波形検知」(@antiplastics#wacode

2015-09-05 13:06:03
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

実験系研究者が目視で異常な波形を示すサンプルをチェックしていた。それを自動化できないか。 #wacode

2015-09-05 13:14:24
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

「そのままでは使いづらいDNAメチル化データの解析」(@wakuteka#wacode

2015-09-05 13:28:03
もじゃもじゃのほう (Koki Tsuyuzaki) @antiplastics

changepointパッケージ(変化点検出)で、エピジェネの変化点を検出した #wacode

2015-09-05 13:39:11
もじゃもじゃのほう (Koki Tsuyuzaki) @antiplastics

MDL plot(ドメインサイズ vs メチル化レベルプロットのプロット)という可視化方法を考えた。細胞の分化度で形が変わることがわかった。 #wacode

2015-09-05 13:45:19
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

「古代ゲノムにおけるDNAメチル化解析手法」(@KaeKogane#wacode

2015-09-05 13:56:14
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

古代人ゲノムはコンタミが大変。恐竜のゲノムとして発表されたサンプルがhumanと最も近くクラスタリングされた例も。 #wacode

2015-09-05 14:04:00
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

塩基のdeaminationが起こる(C->U) #wacode

2015-09-05 14:04:27
もじゃもじゃのほう (Koki Tsuyuzaki) @antiplastics

Jurassic parkのように琥珀内の蚊から血液サンプルとる研究は実際にあった(実際は現代人の配列のコンタミだった。 #wacode

2015-09-05 14:04:30
もじゃもじゃのほう (Koki Tsuyuzaki) @antiplastics

恐竜(と思っていたDNA)とヒトが系統樹で隣だった(爆笑 #wacode

2015-09-05 14:06:06
Haruka Ozaki (尾崎遼) @yuifu

サンプリングの段階からコンタミネーションを防ぐ工夫。汗一滴でもたくさんのDNAが含まれる。サンプルは次亜塩素酸でゴリゴリ洗う。 #wacode

2015-09-05 14:07:19
wakuteka @wakuteka

そのままでは使いづらい古代ゲノム (1) コンタミ nature.com/nature/journal… (@KaeKogane ) #wacode

2015-09-05 14:07:21
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