生命情報若手の会 day2 (2010)
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Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
2008年までのGenBankの累積塩基数が100Gb。HiSeq2000はその２倍を８日で。くるっとる、、、。イメージデータ32TB/run、強度2TB/run、ベースコール 250GB/run、アラインメント結果は6TB/run。 #bioinfowakate
2010-10-10 12:30:03
Ohue M/大上雅史
@tonets
HiSeq2000が1run・8日で200Gb吐く。200GbはGenBankの累積データ量の２倍相当。 #bioinfowakate
2010-10-10 12:30:16
Takeshi Obayashi
@dancing_infobio
Recently illumina sequencer doesn't output raw image data. #bioinfowakate
2010-10-10 12:43:16
Shuji Suzuki (shu)
@shu65
200Gbってwww RT @tonets: HiSeq2000が1run・8日で200Gb吐く。200GbはGenBankの累積データ量の２倍相当。 #bioinfowakate
2010-10-10 12:47:32
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
Illumina Idea Challenge: イルミナが提供するデータを使って革新的で画期的なこと（ビジュアライゼーション・解析技術）をするソフトウェアを募集。賞金$50K。 #bioinfowakate
2010-10-10 12:48:36
Takeshi Obayashi
@dancing_infobio
Scientific presentation by company is not easy. Workshop may be too formal place. #bioinfowakate
2010-10-10 13:10:43
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
やはりアンケートで聞きたい内容を提示する方法はかなり良い。そこでは聞きたい話がちらほらでてきた。 #bioinfowakate
2010-10-10 13:22:32
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
東工大・丹谷さん：進化的起源を同じくする酵素群における機能的差異とドメイン構成の多様性. 同じ触媒部位を持つSCOPファミリーで、多様なEC番号やドメインを持つサブクラスを抽出、特有なドメインを解析。ドメイン構成とEC番号の相関が示唆される。 #bioinfowakate
2010-10-10 13:34:04
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
理研CDB・入江さん：脊椎動物ファイロタイプ仮説検証と発生学的構造特性の示唆。いろいろな生物の初期胚のそれぞれのステージのアレーを総当たりに比較、一番似ている段階をとらえ、hour glass/cone modelのどちらかを確認。前者を支持？ #bioinfowakate
2010-10-10 13:53:29
Ohue M/大上雅史
@tonets
発生に関する保存モデルを検証。よくある発生初期が保存されているとするコーン型と、発生中期が保存されているという砂時計モデル。結果は砂時計型を支持。 #bioinfowakate
2010-10-10 13:57:41
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
久留米大・矢原さん：利己的なホーミング・エンドヌクレアーゼ遺伝子の自立的進化。 #bioinfowakate
2010-10-10 14:17:17
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
若手の会、前回と今回で発表者はそんなにかぶっていない（新規の発表者が多いことは若手の会がうまくまわっている証拠でもある）が、運営サイドで前回とかぶって発表している人たち、1年半しかたっていないとは思えないくらいみんな成長している。 #bioinfowakate
2010-10-10 14:34:45
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
遺伝研・佐藤さん：脊椎動物研究の比較基盤として重要な深分岐魚類ポリプテルスにおけるトランスクリプトーム大量配列決定の試み #bioinfowakate
2010-10-10 14:50:32
Nobuyuki Fujii
@nob_fj
話に出した宣伝です。セルイノベのNGSwikiです。 http://cell-innovation.nig.ac.jp/wiki/tiki-index.php #bioinfowakate
2010-10-10 16:13:43