#AJACS 第1回 RDF講習会
-
- いいね！11
小野 浩雅 ONO, Hiromasa
@h_ono
第1回 RDF 講習会の発表資料は講習会ページに随時アップロードされていきます。 wiki.lifesciencedb.jp/mw/RDF-Tutoria… #AJACS
2016-10-07 13:32:35
小野 浩雅 ONO, Hiromasa
@h_ono
午後は、DBCLS片山さんによる「RDF 開発のためのサービス」tinyurl.com/20161007-rdf-s… からスタートです。 #AJACS
2016-10-07 13:33:56
meso_cacase
@meso_cacase
TogoWS (togows.org) は、各種公共DBをREST APIで検索したり、データをRDFを含むさまざまなフォーマットで得ることができる。 #AJACS
2016-10-07 13:34:32
meso_cacase
@meso_cacase
TogoWSからUCSCのゲノムを検索・取得できる機能もスマートですよね twitter.com/mishimahryk/st… #AJACS
2016-10-07 13:40:49
三嶋博之
@mishimahryk
というわけで @tktym さんのご尽力で、TogoWS towows.org 経由でUCSC Genome BrowserがREST API対応に！URL一発で指定区間のゲノム配列が入手できます！ENCODEデータの部分情報もURL一発です！一発！一発！
2014-10-21 14:11:29
Takanori Hayashi
@tzhaya
TogoDBでのデータのDB化・RDF化の支援．表形式からDB化，HTML/CSS/JSをカスタマイズ，オントロジーやメタデータを追加してRDFを生成，SPARQLにも対応．など #AJACS
2016-10-07 13:45:44
meso_cacase
@meso_cacase
TogoDBは、自前のTSV/CSVデータをアップするとDB化してウェブ経由で検索できるようにしてくれる。画面に従ってクリックしていくだけで簡単にデータを公開or限定公開できる。実は自動的にRDF化もしてくれる。 #AJACS
2016-10-07 13:49:27
meso_cacase
@meso_cacase
TogoDBはSPARQL検索もできるのか。私も利用しているけど、ここまでいろいろなことができるのは知らなかった。SUGOI… #AJACS
2016-10-07 13:51:02
Takanori Hayashi
@tzhaya
なぜこのような取り組みか？生命科学分野のデータベースの主流はMySQL．データベースに関する論文を集める特集号172報のうち45がMySQLだった． #AJACS
2016-10-07 13:52:32
meso_cacase
@meso_cacase
自前のデータをTogoDBに突っ込んで生成したRDF、午前中の @skwsm さんの講習のおかげでちゃんと自分で読めるようになりました #AJACS
2016-10-07 13:55:26
Takanori Hayashi
@tzhaya
SPARQLの基本構文．まずPREFIXを書く．検索条件は S P O でかく．?で始まるものが変数 #AJACS
2016-10-07 14:05:48
Takanori Hayashi
@tzhaya
SPARQLはRDFストアに含まれるグラフの中からほしい部分だけをパターンマッチでたどってゆくクエリ言語 #AJACS
2016-10-07 14:08:11