STAP細胞論文の検証経緯について-片瀬

STAP細胞論文の疑惑について、私が関与した検証の経緯をピックアップしました。 最近フォローされた人が多く、こうした経緯をご存知ない人達が多いので、まとめました。 また、次の記事に私の考えをまとめて書いております。 SYNODOS:STAP細胞の問題はどうして起きたのか(2014.03.28 Fri) 続きを読む
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[Nature Articleの細胞画像のブロックノイズの件]

片瀬久美子🍀 @kumikokatase

.@horikawad 小保方さんのNature論文の図5dですが、PDFを拡大してから画像のコントラストと明るさを変えてみると、背景の塗りつぶしをしている様には見えません。  http://t.co/iyyu1lXK0f

2014-02-14 09:34:08
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片瀬久美子🍀 @kumikokatase

.@horikawad 縮小している図の場合は「ブロックノイズ」という現象があるので、背景が塗りつぶされている様に見えたのはそのせいではないでしょうか? http://t.co/UbCOMGvBHi

2014-02-14 09:35:41
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

.@horikawad ついでに小保方さんのNature論文の図1bですが、PDFを拡大してから画像のコントラストと明るさを変えてみると、こちらも周囲の背景を不自然に塗りつぶしをしている様には見えません。  http://t.co/x7Toqu4nti

2014-02-14 10:01:20
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片瀬久美子🍀 @kumikokatase

(論文不正の指摘も、できるだけフェアにいかないとね)

2014-02-14 10:04:13

[DNAアガロースゲル電気泳動写真の件]

片瀬久美子🍀 @kumikokatase

【再】DNAの電気泳動写真の方は、切り貼りの疑いが濃厚ではないかと思います。こちらもPDFを拡大してから画像のコントラストと明るさを調整しましたが、バックグラウントの不連続が確認できます。  http://t.co/mGfuSRy9SA

2014-02-14 11:19:48
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[Nature letterの胎盤写真の類似の件]

片瀬久美子🍀 @kumikokatase

.@PKAnzug 指摘されている胎盤の写真の類似性は、私の方でも検証してみました。とても似ていますね。  http://t.co/YcmcCarkuy

2014-02-14 12:27:07
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片瀬久美子🍀 @kumikokatase

.@PKAnzug この写真は図2gに図1bの胎盤部分の写真を並べたものです。  http://t.co/l0XaDnDsrO

2014-02-14 12:29:03
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片瀬久美子🍀 @kumikokatase

この画像を「形態の類似」を示したものとしてではなく、「切り貼り」証拠だとして使用している人は、直ちにそうした使用を止めて下さい。ネットの多数のサイトにこの画像を「切り貼り」の証拠として投稿したものは削除して下さい。 http://t.co/4oSUKt8dyy

2014-02-16 12:08:15
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片瀬久美子🍀 @kumikokatase

私が作成した画像が、無断で別の説明を付けてネットで拡散されていますので、説明を付けたものを新たに作りました。もし、「コピーペーストの証拠」等と間違った使われ方をしているのを見かけましたら、この図を提示して下さい。ご協力をお願いします。 http://t.co/ky6eifF9Ac

2014-02-16 18:28:13
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[Nature Article 図1fの画像の件]

ながぴい @Nagapiii

@kumikokatase http://t.co/bzifwKsTqs Knoepfler氏の新エントリでは、図1fのピクセルノイズに不自然なところがあるとしていますね。これについてはどうお考えですか?

2014-02-24 18:13:56
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

@Nagapiii この写真に関しては、動画も同時にNatureから提供されていますが、動画の方はずっと連続して撮影してあり、それを見た感じでは突然細胞が入れ替わったりという不審な印象は受けませんでした。

2014-02-24 19:34:58
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

@Nagapiii 動画ありました。この理研のサイトにリンクされています。 http://t.co/vBLvG8lboh

2014-02-24 22:17:16
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

@Nagapiii 理研のサイトにある動画を見ると、緑に光った細胞2つの内、右側の方は動きが少なくて、ずっと存在し続けているのが確認できます。左側の方は、途中で移動したのを視野に戻した感じがありますね。少なくとも、右側のGFP蛍光のある細胞の入れ替えは無さそうに見えます。

2014-02-24 22:27:25
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

@Nagapiii 私の記憶違いで、理研のサイトで紹介されていたのを、Natureの方で紹介されていたと思ってしまったかも。。。理研のサイトの動画と、図1fの細胞は同じものだろうと思います。

2014-02-24 22:44:59
ながぴい @Nagapiii

@kumikokatase Knoepfler氏のブログに、理研のサイトに元となったと思われる動画があることを書きこんでおきました。http://t.co/Y5ehTDRTbd

2014-02-25 10:41:29
ながぴい @Nagapiii

@kumikokatase あの理研の動画をキャプチャすると、わりとそれっぽくd0からd3まで再現できることを確認しました。(論文の図より解像度はようなります)

2014-02-26 23:43:12
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

ご苦労様です。ということは、この件に関しては変な疑惑はないということになるでしょうね。 RT @Nagapiii @kumikokatase あの理研の動画をキャプチャすると、わりとそれっぽくd0からd3まで再現できることを確認しました。(論文の図より解像度はようなります)

2014-02-26 23:44:54
ながぴい @Nagapiii

d0, d1とd2, d3ではキャプチャの仕方とか解像度が違うだけかもしれません。RT@kumikokatase ご苦労様です。ということは、この件に関しては変な疑惑はないということになるでしょうね。

2014-02-26 23:50:35
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

理研の動画では、矢印された2つの細胞の内、少なくとも右側のGFP蛍光がある細胞は入れ替えがなさそうですし、そこからのキャプチャであれば、図の捏造というのはなさそうですね。RT @Nagapiii d0, d1とd2, d3ではキャプチャの仕方とか解像度が違うだけかもしれません。

2014-02-26 23:54:33
片瀬久美子🍀 @kumikokatase

画像を確認しました。かなり論文の画像と近いですね。細胞の位置がほぼ一致しています。 RT @Nagapiii @kumikokatase 画像は一応ミクシイのほうに置いてあります。

2014-02-26 23:59:32
ながぴい @Nagapiii

でしょ?範囲と画面をちゃんと選べばもっとよく似せることができるんちゃうかな?(しかも解像度もこっちのほうがいい)まあ、わたしゃこのへんでやめときますけど。RT@kumikokatase 画像を確認しました。かなり論文の画像と近いですね。細胞の位置がほぼ一致しています。

2014-02-27 00:03:31