第 2 回数理生物カフェ

hideichi saito @binbin4649

微生物、目に見えない生物、0.2ミリくらい #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

クラゲもプランクトン #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

別種ってどっちから見ても別種なのでは という質問 #mathcafe_biomath

つかの@量子コンの入門書発売中 @snuffkin

たいていの種は見た目で決める。微生物は見えないので、DNAの同相性で決める。数学的には、ハミング距離？ #mathcafe_biomath

hideichi saito @binbin4649

相同性は97％で大体同種 #mathcafe_biomath

Yu Nakajima @nkjmu

@binbin4649 より正確にいうと、97％以下になると（ほぼ）別種ですが、97％以上であっても同種か別種かはわかりません。16Sで99％近く相同であっても別種である例は多いので。　#mathcafe_biomath

hideichi saito @binbin4649

97％を導き出す分母はどっち？ #mathcafe_biomath

つかの@量子コンの入門書発売中 @snuffkin

長さがちょっと違うことがあるから、編集距離か。 #mathcafe_biomath

あり @ta_to_co

人とチンパンジーではゲノムのサイズが違う． #mathcafe_biomath

hideichi saito @binbin4649

人とチンパンジーは98％同じらしいが、長さが違うので単純に計算できない。98％はどうやって計算したんだ？ #mathcafe_biomath

あり @ta_to_co

98%はどこをとっているのかがわからない．そのため，微生物の判定に かかる97%は違う． #mathcafe_biomath

Yu Nakajima @nkjmu

@ta_to_co 昨日言っていた、「ちょうどいいサイト」はこちらです gigazine.net/news/20150721-… #mathcafe_biomath

つかの@量子コンの入門書発売中 @snuffkin

DNAのどこを比べて「99%一致」とか言っているのか注意。 #mathcafe_biomath

あり @ta_to_co

1500文字で何がわかるのか？ #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

問題の部分の原文（前半） The life forms—40 different strains of microbes and even some viruses— #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

元記事の元記事URL m.phys.org/news/2017-02-b… #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

ナショジオの記事が一番まともかも。 news.nationalgeographic.com/2017/02/crysta… #mathcafe_biomath

hideichi saito @binbin4649

大腸菌を進化させる。1日で6.6世代すすむ、29年やってる。変異はあったか？ #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

私がメキシコの洞窟にハマってる間に突然変異になってる #mathcafe_biomath

じゃくりーぬ @JacquelineAmano

遺伝的浮動 genetic drift 集団が大きいと有利な変異が集団内に残る #mathcafe_biomath

hideichi saito @binbin4649

ポッとで、ハイパーミューテーション #mathcafe_biomath