オックスフォード・ナノポア現場の会 2017東京
MinION(ミナイオン)、GridION(グリッディオン)、PromethION(プロメシィオン)、MinKnow(ミンノウ) #nanoporejp
2017-08-22 10:22:10@suimye FLONGLE、いまのフローセルに含まれているICの部分はもったいないので使い捨てにせず、ナノポアのメンブレンだけを交換可能にすることによってコストを抑えるという話だと思います #nanoporejp
2017-08-22 10:45:47開発中の診断用MinION(MinION Dx)にFLONGLEという新しいdeviceデザインがあるようです。詳しくは...
https://twitter.com/NanoporeConf/status/804808439381819393
https://nanoporetech.com/about-us/news/brief-oxford-nanopore-updates-nanopore-community-meeting-new-york
Topバッターは慶応大学の荒川先生です。
午後7時くらいにホテル到着後すぐシーケンス開始、飲み食いしながら遠隔でモニタリング #nanoporejp
2017-08-22 10:39:51「そういえば結局里芋って読めたのかな。」
解説:
NGS現場の会2017では、山口情報芸術センター(YCAM)との共同企画で、ゲノム芋煮と題して、学会会場で里芋のゲノムを読むイベントを実施していました。その結果については、いまいち読めなかったという速報がありましたが、最終的な結果については不明です。
一般的には、デンプン質の多い試料(コメやじゃがいも)の場合は、ゲノムDNA精製にはαアミラーゼを用いたミニプレップを行う必要があります。
トリビア:バクテリアのコンプリートゲノムは、出張先で学会に参加しながら決定できる。 #nanoporejp
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