愛知県と岐阜県の感染ルートを視覚化する実験物理学者さん

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

今日の新規 Mac は +3 です。昨日の +2 から微減。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

東海 3 県の感染者の情報は中京テレビが一覧にしていた。「感染経路不明」は 207 名中 22 名。 ctv.co.jp/covid-19/perso…

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

クラスターの把握なんてこっから人数増えたら絶対できないよ。止めるしかないんだよ。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

複数の対策がほぼ同時期に起きたので切り分けできるのかという疑問はあるが、休校は効かないということはないというのがこの論文の図。専門家会議の「子どもは感染拡大の役割をほとんど果たしていないと考えられる」はどういう根拠だろう。日本は少人数制じゃないし。 spiral.imperial.ac.uk:8443/bitstream/1004… pic.twitter.com/81RuQsNJ8G

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OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

（現時点で不明なだけかもしれないが）愛知県では「感染経路不明」となっている新規感染者が続々と出始めている。ctv.co.jp/covid-19/perso…

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

感染の樹形図を作りたいのだけど、graphviz よりもかっこいい感じで作れる Python のモジュールないですかね

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

東京都 684 人、愛知県 189 人。人口はそれぞれ 1395 万人と 755 万人。人口比で見ると、愛知も状況は芳しくない。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

自分が小学生の頃は東京の人口は 1000 万人だった気がする。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

@ohmura_hideaki 250 床くらいではすぐに足りなくなるというのが他都市圏で起きつつあることです。クラスターを辿れているから大丈夫という対策班の過信が東京の現状を引き起こしています。対岸の家事ではありません。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

（今まで人に見せた ROOT の図で一番汚いと思うけど）愛知県内の感染者の伝播の様子。 pic.twitter.com/oJyV0DkEBd

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OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

これは ROOT の graphviz interfece なんだけど、かなり使い勝手が悪そうで、見た目の修正が困難っぽい。他のライブラリ使おう。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

縦位置を月日でちゃんと揃えたりしなくてはいけない。横に進む方がいいかな。で、上に時系列の対数グラフも並べる。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

海外や東京のニュースばかり追っていて、自分の県内の情報をちゃんと可視化して追えていないので、そろそろまずいな、奥村動きます、みたいな感じで。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

元データは中京テレビ提供の（というか、勝手に directory 掘ってるだけだけど）、CSV ファイル。リンクが整理されているので使いやすい。ctv.co.jp/covid-19/data/…

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

愛知県は「クラスターを追えている」という過信が初期の東京と同様にあると危惧していて、一方で孤発事例が一定に出続けているのを僕は心配しております、はい。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

@jseita そうなんです。すぐ使える interface を使ったら、縦にしか進んでくれなくて。他の library にします。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

ROOT の graphviz interface は、矢印の大きさを変更することすらできないっぽいので、これは駄目ですね。丸（node）の形状も変更できない。この僕が変更できないので、変更できない仕様なんでしょう。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

原発のときは専門が比較的近いし、やる人が多くなかったので色々とやったけど、今回は素人だし、可視化する人が増えて良い世の中になったので傍観していたけど、科学者は自分でやっぱり作図したくなるね。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

僕がこんな汚い作りかけのひどい図を公開してしまうというのは、危機感の現れです。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

@jseita 横軸は 365 日分くらいで足りるといいですねえ

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

僕の汚い図を RT する人は、「普段の奥村の作図能力はこんなものではない」って一緒に RT しておいてください。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

うーん、樹形図を作るの難しいな。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

@kfuku0502 ETE 使った場合、各ノードの位置を棒の長さではなく、ノードの横軸での絶対値で位置指定するようなことはできるでしょうか。やりたいことは、感染者の陽性確定日を横軸で並べたいのですが、感染元の月日といちいち引き算したくないという意図です。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

陽性確定日の日付、月日じゃなくて年月日のフォーマットで出している機関が、一番信頼できそうな気がしてきた。2020 年でこれは終わらない。

OKUMURA, Akira（奥村 曉） @AkiraOkumura

慣れていないだけの可能性は高いが、ETE も思った通りのものが描けないな。