DBCLS BioHackathon 2010

@gaou_ak

RT @matthiassamwald: wait, the official tag is supposed to be #biohackathon2010, but ustream seems to be set up to use #biohack -- we need semantic alignment!

@gaou_ak

BioGateway: システムバイオロジーのためのRDF store。クエリを複雑化できることに力を発揮。データ統合・統合的アプローチによる検索・仮説導出と推論にセマンティックウェブは有用。 #biohackathon2010

@_shk

セマンティックウェブが描くゴールの景色とそこに至る前の技術とか、やらんとあかんこととの間でギャップというか、なにか大きなものが立ちはだかってる気がしてしまう

@synobu

Matthias Samwald: High-level knowledge representation on the Semantic Web: the Concept Web Alliance and related efforts #biohackathon2010

@_shk

述語決めたりするのが人手がかかるからそう思ってしまうのかなあ。

@_shk

バイオロジーの場合一つのentity あたりが持つ関係が多すぎるしなあ。

@_shk

それを考えるとLinkedDataを目指すのが妥当か。

@kumamushi

#biohackathon2010 <a>Tag http://hcls.deri.org/atag/generator/

@synobu

<a>Tag project: light-weight representation of semantic ontology http://hcls.deri.org/atag/generator/ #biohackathon2010

@_shk

テキストにタグ埋め込む系。

@32nm

"Standing on <del>the shoulders of giants</del> clouds" #biohackathon2010

@yaskaz

ハッシュタグ biohackathon2010 をチラ見しつつ三島デスクにてぎょーむに着く

@orenotwitter

I changed ustream tag to official tag #biohackathon2010 QT @matthiassamwald the official tag is #biohackathon2010, but ustream use #biohack

@orenotwitter

I changed ustream tag to official tag #biohackathon2010 QT @matthiassamwald the official tag is #biohackathon2010, but ustream use #biohack

@gaou_ak

Matthias Samwald: Concept Web Alliance. aTag (http://bit.ly/bsPDb2)の説明。PubMedなどに簡単にRDFaタグをつけられるBookMarkletや、それを検索する手法。 #biohackathon2010

@_shk

web alliance か～。はじまってるんやなあ。

@jugglingbits

#biohackathon2010 @matthiassamwald's aTag bookmarklet crashed my chrome :-)

@synobu

Jerven Bolleman: UniProt in RDF #biohackathon2010

@gaou_ak

Thomas Kappler: UniProt in RDF, 全てのデータがRDF化されていて、簡単に取得できる。taxonomyやMedlineなど、必要なデータもRDF化している。PURLsも。 #biohackathon2010

@jugglingbits

#biohackathon2010 Jerven is speaking about UniProt. Jerven and I (Thomas Kappler) are both working on it, feel free to ask us questions.

@matthiassamwald

#biohackathon2010 quick survery: >80% participants know 'RDF', 80% know 'Linked Data', ~40% 'used RDF'

@gaou_ak

多くの既存ユーザのために、Flatfileは已然として必要。keyword queryは85%。latencyはUIとして重要。 #biohackathon2010

@gaou_ak

バイオインフォは基本的にパーサを書く作業から始まる。少なくともこのコストをなくす事に意義がある。SPARQLは複雑な問いを可能にする。OWLによる推論までいければ嬉しい。 #biohackathon2010

@synobu

François Belleau: Bio2RDF cognoscope: A killer app for the life science. #biohackathon2010

@_shk

すごいなあ。バイオ系SWの人大集合してるんちゃうん。