#bh2010 統合データベース技術情報交換ワークショップ四日目

http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/index.php/BH10.10 四日目(2010年10月21日)
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Kozo Nishida | 西田孝三 @kozo2

@c_z CytoscapeWebってどれくらいの規模(ノード数、エッジ数)の表示に耐え得るかってどこかに書いてありましたっけ

2010-10-21 10:35:36
Takeshi Obayashi @dancing_infobio

Until the midnight, we discussed "Englishnization" in Japan in the context of cultural diversity. #bh2010

2010-10-21 10:45:08
猫教授 @yaskaz

午後に参上します。要り用なものがあれば書いといて。酒、ツマミ、おやつ、水、文房具ナド。調達困難だったりあまりにも高価なものは却下な #bh2010

2010-10-21 11:26:40
Kozo Nishida | 西田孝三 @kozo2

@c_z CytoscapeWebでもCytoscapeにも対応するsifでないフォーマットってxgmmlになるんでしょうか.graphmlだとCytoscapeにimportできないように思うのですが

2010-10-21 11:49:33
Kozo Nishida | 西田孝三 @kozo2

考えられている大きな野望の流れとcgiを理解していなかった

2010-10-21 11:50:38
まこ @ma_ko

午前中までの進捗発表開始ー #bh2010

2010-10-21 11:50:52
Kozo Nishida | 西田孝三 @kozo2

ああ、そっかだから @c_z さん朝にGraphMLのリーダーの原型みたいなのはもう出来てるんですか?って仰ってたのか

2010-10-21 11:52:59
Kozo Nishida | 西田孝三 @kozo2

xmlフォーマットの違いメンドクサイなー

2010-10-21 11:53:27
Takeya Kasukawa @kasukawa

Galaxyはパイプライン作ったり,ツール追加したり #bh2010

2010-10-21 11:57:13
山本 泰智 (Y. Yamamoto) @yayamamo

togows、糖鎖関係処理の機能拡張に併せてBLAST対応なども。 http://togows.dbcls.jp/ #bh2010

2010-10-21 11:57:33
(^_^)/ @_shk

@kasukawa レポートありがとーございますー #bh2010

2010-10-21 12:04:06
Takeya Kasukawa @kasukawa

Cytoscape/WebAPI連携はゴールの検討(cytoscape webとstandaloneのシームレス連携?) #bh2010

2010-10-21 12:04:21
Takeya Kasukawa @kasukawa

OCはテクニカルタームの定義,サービスの設計, TogoWS の Blast検索実装へのプレッシャーw #bh2010

2010-10-21 12:05:26
Takeya Kasukawa @kasukawa

以上午前のまとめ,最初の2件ほど抜けているので関係者よろ #bh2010

2010-10-21 12:06:52
Wataru IWASAKI @iwasakiw

お先に失礼しますー,オーガナイザーの皆さまありがとうございました.多くの方にオフラインでお会いできて,またいろいろと勉強させていただき有意義でした:-) #bh2010

2010-10-21 12:58:35
Kazuharu Arakawa @gaou_ak

TogoWSでBLAST実装するようだが、とりあえずはG-language EMBOSS/KBWS REST Service をwrapしてもらえれば一瞬で実装可能かと。例えばhttp://bit.ly/aogngu #bh2010

2010-10-21 13:43:04
Kazuharu Arakawa @gaou_ak

ドキュメントはこちら。http://bit.ly/bC0Vo8 program, database, serverはある程度自動でも推定してくれます。 #bh2010

2010-10-21 13:43:49
オープンデータ推進者なので情報共有しない鍵垢はフォロー解除するぼうのうひでまさ @bonohu

@takakoron 昨日はお疲れ様でした〜途中でついていけなくなって、なぜかNIG経由で帰りましたぁーーーーーーーーーーーー☆

2010-10-21 13:52:07
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