ieee バイオインフォ&バイオエンジニアリング ツイート集
RNAに回文を探す、という話。 厳密は難しいのでエラーは許容。 ヘアピンみたいな相補回文も含む。 長さnの3乗の計算アルゴリズムを提案。 基本は動的プログラミング #BIBE2016
2016-11-01 15:02:16Using deep learning with position specific scoring matrices to identify efflux proteins in membrane and transport proteins S Taju #BIBE2016
2016-11-01 15:02:50A Tool for Searching Palindromes in RNA Sequences bioinfo.csie.nfu.edu.tw/palindrome/ind… #BIBE2016
2016-11-01 15:03:59普通にUniProtから膜貫通たんぱくを持ってきて冗長性を除去。 PSSMを作ってDLで学習。2クラス判別。 70から80%の判別は可能 #BIBE2016
2016-11-01 15:13:00Fine classification of human gut microbiota by using hierarchical clustering approach Chen Tzufan #BIBE2016
2016-11-01 15:17:51最後のキーノート Evolution of Cancer Genomes Wen-Hsiung Li bibe2016.asia.edu.tw/keynote-speech… #BIBE2016
2016-11-02 09:37:02en.wikipedia.org/wiki/Wen-Hsiun… 講演者のwikipedia #BIBE2016
2016-11-02 09:41:20がんでは分裂が速いと変異率も高いことが分かっている。 somaticな細胞の変異のほ方が速い(188%増) たんぱくコード領域の変異は抑制的だが、度合いは生殖細胞より体細胞はずっと弱い。 #BIBE2016
2016-11-02 10:00:21がんの変異はPPIの変異とみなせる。PPI HUBの変異の方ががんに関係するか? ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24881052 確かにがん遺伝子はHUBが多い。 #BIBE2016
2016-11-02 10:10:36The latest ホンマのニューズペーパー! paper.li/honma_yuu/1305… Thanks to @suishess @kozo2 @riken_en #bibe2016 #science
2016-11-02 10:46:43The latest デイリー にゃあ! paper.li/kirikami/13057… Thanks to @Yh_Taguchi @matsubara_m @miyoyon #タイツの日 #bibe2016
2016-11-02 18:37:31