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オックスフォード・ナノポア現場の会 2017東京

オックスフォード・ナノポア現場の会が、2017年8月22日に東京丸の内のコンファレンススクエアM+で行われました。事前登録が一日で100名を越える盛況で、当日は200名ほどの参加者が会場を埋めた。こちらのまとめでは、公式ハッシュタグ、#nanoporejpでつぶやかれた内容をまとめています。 ご講演くださった2名から、講演内容を共有していただきました。ありがとうございました。 藤本先生、三橋先生, これからナノポアをはじめるときに知っておいたほうがいい情報について: https://docs.google.com/document/d/1UgiCU1kYP7ub8_ROuTsvsA-L5DbtyDSgH1yNFetRyXM/edit?usp=sharing 続きを読む
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カエルプリンセス @suimye

トランスポゼース使ってるので、DNA溶液はEDTANaフリーで。 #nanoporejp

2017-08-22 16:34:56
カエルプリンセス @suimye

ニックローマンのウルトラロングリード調整プロトコルがグーグルドックスに共有されている。 #nanoporejp

2017-08-22 16:35:59
:marimiya @marimiya_clc

ウルトラロングリードのプロトコルは、ここ。docs.google.com/document/d/102… #nanoporejp

2017-08-22 16:37:16
カエルプリンセス @suimye

ベントーラボ、15万くらい。製品版前に購入。サーマルサイクラーは1秒間に2度。発売は順調に遅れている。 #nanoporejp

2017-08-22 16:38:47
Ikemen Mas Kot @maskot1977

お弁当のような気軽な解析は良いけど、手弁当による解析になりませぬように #nanoporejp

2017-08-22 16:42:03
カエルプリンセス @suimye

バクテリアゲノム配列を決めるときに、C●Cワークベンチのエラーコレクションツールを利用してからアッセンブリー。 #nanoporejp

2017-08-22 16:44:20
Ikemen Mas Kot @maskot1977

全てのトークが終了いたしました。最後のトークが最も多くの笑いを獲得しました。 #nanoporejp

2017-08-22 16:45:20
カエルプリンセス @suimye

エラーコレクションの話。しーまるしーいがいだとCaru(のなかのミニマップ)つかうのが選択肢かな?という話。 #nanoporejp

2017-08-22 16:49:16
酵母の中の酵母 @Beer_yeast

壇上から質問する新しいスタイル #nanoporejp

2017-08-22 16:50:18
カエルプリンセス @suimye

Nanoporeでde novoアッセンブリーのパイプラインも開発中ぽい #nanoporejp

2017-08-22 16:50:41
カエルプリンセス @suimye

バーコードつけて複数検体という話。 バーコードつけるとアンノーンリードが3割くらいでる。#nanoporejp

2017-08-22 16:52:31
ほねつきにく @i_za_world360

バーコーディングで3割〜5割のデータロスが出る#nanoporejp

2017-08-22 16:52:49
酵母の中の酵母 @Beer_yeast

もうbento lab相当品を作っちゃえばいいんじゃないかな #nanoporejp

2017-08-22 17:05:07
ほねつきにく @i_za_world360

リード長とスループットはトレードオフかー。 #nanoporejp

2017-08-22 17:08:27
カエルプリンセス @suimye

どれくらいの長さでどれくらいのモル濃度アプライすれば良いか、これでスループットが結構変わるので重要 #nanoporejp

2017-08-22 17:09:23
カエルプリンセス @suimye

ウルトラロングリードのローマンのプロトコルでは、ライブラリローディングビーズを使わない。 #nanoporejp

2017-08-22 17:11:48
カエルプリンセス @suimye

2回目以降使うときのコツは? ポアオキュパンシーが低い状況ではポアがへたりやすい。 空気が入ってないように見えて入っているとまずい。 ウォッシュバッファでウォッシュをしっかりと。 キャリーオーバーけっこうある。 不要物が入ってると良くない。 #nanoporejp

2017-08-22 17:18:19
カエルプリンセス @suimye

初めのに躓く空気入れる問題について プライミングをしないで済むフローセル開発中 #nanoporejp

2017-08-22 17:28:21
Ikemen Mas Kot @maskot1977

みんなー!無料イベントに参加した時はアンケートに答えるんだぞ!アンケートが満足に得られないと、無料イベントを開催した意義がなかったと判断されて、もう無料イベントやってくれなくなるぞ!(`・ω・´) #nanoporejp

2017-08-22 17:31:33
カエルプリンセス @suimye

資料、スライドシェアして、つぶやいてくれるそうです! #nanoporejp

2017-08-22 18:42:31
カエルプリンセス @suimye

今日は暴れまくりました( ꒪⌓꒪) #nanoporejp

2017-08-22 21:04:23
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