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parasite2006
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地下楽師＠Ph.D
@tonkyo_Vc
それには相当の時間とコスト、サンプルが必要なわけでしかもそれがリファレンスとなる確定診断のゴールドスタンダードか存在しない条件下で行うとなれば、その必要なデータのサイズは更に増大する、これがcovid-19の「検査」が少なくとも検査として意味のある結果を出すために必要なこと
2020-02-24 18:24:54
地下楽師＠Ph.D
@tonkyo_Vc
勿論、現時点でそれは全く整備されていない(当たり前)なので、そこでいたずらに検査をただやっても、検査された本人の行動の判断にも使えないし今後の感染予防に必要な疫学調査にも使えないゴミデータの蓄積にしかならない。加えて検査は治療に対して何も有益な情報を提供しない
2020-02-24 18:27:46
地下楽師＠Ph.D
@tonkyo_Vc
covid-19特異的な治療法がない以上、臨床的症状にあわせた治療選択(要するに風邪様症状なら風邪の処方、肺炎様症状なら一般的な肺炎の処方)をするしかないので、そんなのは検査をわざわざするまでもなく医師が診断可能。そういうことわかってマスコミとかは情報発信してますか？
2020-02-24 18:31:52
地下楽師＠Ph.D
@tonkyo_Vc
もしそれが「わかっている」上でそういうこと主張しているなら、それは「人命よりも○○を優先」という思想信条のもとに情報発信をしていると判断せざるを得ない
2020-02-24 18:35:57その2：RNAウイルスの迅速診断キットで迅速化できる操作段階は限られている
おろろ
@fYe39CoQsPrbZVK
スイスのロシュが出しとる検査キットが喉の粘膜取るだけで検査できるはずなんやが、何で日本は使わんのかのう。情報見たの月始めくらいだったんやが togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 15:41:14
satoukei
@satoukei9
ロシュのキットは roche-as.es/lm_pdf/MDx_61-… これだとすると、こちらもqPCRベースのようですね。 なお検査法については専門家向けですが、 https://www.n.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 16:04:50
おろろ
@fYe39CoQsPrbZVK
.@satoukei9 お、有り難い。キットはRNA抽出してからの判定が分かり易いて類のもんで根本的な解決にはならんて事かな？厚生省が何日か前に、1日3000件ま.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 16:50:59→ 3000件まで行ける言うてたんは何やったんやろか
satoukei
@satoukei9
.@fYe39CoQsPrbZVK 国立感染症研究所のマニュアルには2stepPCR法とtaqmanプローブ(qPCR)法の記載がありますが、rocheのlightmixキットは後者ですね。taq.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 17:34:01→ taqmanプローブ(qPCR)法の方がサーマルサイクラーでPCRを行う回数は１回で済む(2stepPCRだとその名の通り２回)ので若干早くなりますが、その前のrna抽出精製、逆転写が必要なのは同じです。あとqPCRは通常のPCRと異なる蛍光検出器つきのサーマルサイクラー(高い)がいるというのも大きいかと思います。
おろろ
@fYe39CoQsPrbZVK
.@satoukei9 なるほどな。でもなんかマニュアルp12にn-geneとe-gene両方使えみたいに書いてあるけど、これに従うのとその説明足すと、キットの方が手間.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 18:25:51→ 手間かかるんとちゃうの。あとニュースに出てたのは何geneなんやろか
nao
@parasite2006
.@fYe39CoQsPrbZVK 繰り返しになりますが、RNAウイルスの遺伝子検査で一番大変なのは、検査キットに入れて検出反応に持ち込む前の段階、すなわち感染細胞.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 18:52:02→ 感染細胞から病原性を保持したままのウイルスRNAを抽出してくる段階であることを認識していただきたい。この段階は自動化がきかず人手が頼みです。
おろろ
@fYe39CoQsPrbZVK
.@parasite2006 今ツイの方で優しい御仁が抽出もキット使ってて逆転写はツールで用意してあるしチューブから出さんでもええよて教えてくれたけど、その.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 18:56:57→ そのチューブに入れるのが大変て話かの？
nao
@parasite2006
.@fYe39CoQsPrbZVK そうです、そのチューブに入れて反応に使うためのRNAを感染細胞から取り出してくるまでが大変だという話をずっとしています。まとめの.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 19:06:42→ まとめの第1部の後半とそこにあるリンク先をお読みになってからお返事ください。
おろろ
@fYe39CoQsPrbZVK
.@parasite2006 だからまとめにある2と3が感染研で今使ってるキットでやってくれてるて教えて貰った言うとんのやないか。だから1が大変て事でええのなっ.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 19:16:54→ ええのなって。それはそうと最後の方にある東大教授の資料、手遅れ書いてあるけど厚労省見解と一致すんのこれ
（↑「まとめの2と3」とは第1部の解説に書いた「2) 逆転写」と「3) 増幅」の段階をさします。残るのは「1) RNA抽出」の段階です）
nao
@parasite2006
.@fYe39CoQsPrbZVK はい、しかもこの操作はウイルスの入った溶液、飛沫の拡散を防ぐため中の空気を絶えず吸い込みウイルス粒子をトラップするフィルター.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。
2020-02-24 21:40:03→ フィルターを通してから外に出す設備がついた安全キャビネットの中で行わなければなりません。操作の様子はこのニュース記事https://www.fnn.jp/posts/00050249HDK/202002141226_KTV_HDK の上から4枚目の写真をご覧ください。
@F1_ABS
検体採取と輸送のマニュアルはこちら。ここが一番大変。https://www.niid.go.jp/niid/ja/diseases/ka/corona-virus/2019-ncov.html QIAGENのウイルスRNA精製キットのマニュアルDLページ。https://www.qiagen.com/jp/resources/resourcedetail?id=7d6918b1-77dd-4dac-b694-a9ca8aa58b43&lang=ja-JP