新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと

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おろろ @fYe39CoQsPrbZVK

.@F1_ABS なるほど。運搬のために詰めて冷やすまでは病院よね。ほいで、抽出はキットを使っても何度も容器を移し替えて、回したり衝撃与えたりを機械で.. togetter.com/li/1472743#c74… 「新型コロナウイルスのPCR検査を求める人に知っておいてほしいこと」togetter.com/li/1472743 にコメントしました。

2020-02-24 20:54:21

→ 機械でなく手作業でやらないと壊れるて事でええのかな

(TaqMan法は3つの段階のうちの逆転写段階と増幅段階を1本の反応チューブの中で続けて実行できる1-step RT-PCR法のキットです)

nao @parasite2006

.@satoukei9 さんのコメント「.@fYe39CoQsPrbZVK 国立感染症研究所のマニュアルには2stepPCR法とtaqmanプローブ(qPCR)法の記載がありますが、rocheのlightmixキットは後者ですね。taqmanプローブ(qPCR)法の方がサーマルサイクラーでPCRを行う回数..」にいいね!しました。 togetter.com/li/1472743#c74…

2020-02-24 18:08:49
F1ABS @F1_ABS

@parasite2006 @satoukei9 @fYe39CoQsPrbZVK 感染研のrealtimePCRプロトコルで使っているQuantiTect Probe RT-PCR キットは、逆転写酵素も最初から入れてあり、30分のRT反応の後、PCR酵素(Taqポリメラーゼ)を活性化(化学修飾を外す)して直接PCRをかけるものですね。1step RT-PCRなのでチューブを開けずにウイルスゲノムの定量が可能です。 pic.twitter.com/CqEZVl1uqZ

2020-02-24 18:35:38
拡大
F1ABS @F1_ABS

@parasite2006 @satoukei9 @fYe39CoQsPrbZVK ご指摘のようにTaqManプローブで相同配列の増幅を直接モニターしていますから、SYBRグリーンのようなインターカレート色素を使った定量法のように、PCR反応の後に融解曲線を作り、融解温度から目的の増幅産物であることを確認する必要はありません。 (目的外の産物で同じ融解温度が出る場合もある)

2020-02-24 18:40:52

補足2:陰謀論に応えるなとろむ先生の連続ツイート

名取宏(なとろむ) @NATROM

長文です。「医師が検査を保健所に依頼しても断られるのは問題だ」ってのはその通りです。大問題です。ただ、文句を保健所に言っても、たぶんどうしようもないです。

2020-02-26 20:31:52
名取宏(なとろむ) @NATROM

行政で働いていた知り合いの医師もいますが、まあたいへんなんですよ。お役所だから17時で終わりなんて誤解している臨床医もいますがとんでもない。感染症は休日時間外関係なく発生します。普段の業務でそうです。

2020-02-26 20:32:03
名取宏(なとろむ) @NATROM

で、いまは通常業務に加えて新型肺炎で、そりゃあてんやわんやでしょう。検査できるのなら、依頼されたままやるほうが簡単ですよ。クレーム処理もしなくていいです。

2020-02-26 20:32:18
名取宏(なとろむ) @NATROM

でも、おそらくキャパオーバーしていて、優先順位を振らざるを得ない。検査を断られた方が「重症なのになんで検査しないのか」と憤るのは当然です。でも、もっと優先順位の高い人がいたのかもしれないのです。

2020-02-26 20:32:38
名取宏(なとろむ) @NATROM

患者さんを責めないようにしてください。これは仕方ない。でも、プロフェッショナルたる医師はダメですよ。「検査ができないということは病気の判断ができない」などと言っている医師がもしいたとしたら、そいつはヤブです。お前が検査偏重の風潮の犯人だ。

2020-02-26 20:33:15
名取宏(なとろむ) @NATROM

PCR検査が1日3000件可能だとか厚生労働省が発表したそうですが、毎日新規患者を3000人検査できるわけではないです。陽性者のフォローアップや接触者調査もありますし、新規の検査対象者からは複数の検体を検査します。

2020-02-26 20:33:34
名取宏(なとろむ) @NATROM

「感染者を少なくみせかけるために検査できるのにしないのだ」というのは陰謀論の類です。保健所長ってだいたい医師ですよ。医師は医師以外の人の言うことをあまり聞きません。仮に上から「なるべく検査するな」って言われても、はいそうですかと従うものですか。

2020-02-26 20:33:59

(↑かつて保健所長には医師しかなれないという規定がありましたが、この規定は廃止要望を受けて平成16年4月23日=2004年4月23日付けで見直され
https://www.mhlw.go.jp/topics/2004/04/tp0423-2.html
「医師と同等またはそれ以上の高い専門性を有する者に対して、例外を認める」
https://www.mhlw.go.jp/topics/2004/04/tp0423-2a.htm
ということになりました。ただし医師と同等以上の知識、一定期間以上の公衆衛生の実務経験、国立保健医療科学院の保健所長用1年コースの修了の3つの条件が要求され、また例外が認められる期間は2年程度とされています)

名取宏(なとろむ) @NATROM

普通の官僚なら人事権を握られたら忖度するかもしれませんが、医師は医師免許があるので行政をやめてもいくらでも働き口があります。そうまでしてサボタージュする理由はありません。

2020-02-26 20:34:19
名取宏(なとろむ) @NATROM

安倍政権ならそれぐらいの陰謀をやりそう?でも、陰謀をやるなら、「検査をしたことにして陰性の結果を出す」ほうがずっといいでしょう。臨床医から文句は出ない上に、検査陽性÷検査総数の数字の下がって「検査はしっかりしているけど流行していない感」を出せます。

2020-02-26 20:34:49
名取宏(なとろむ) @NATROM

「韓国はあんなに検査をしているのに」という声もあります。韓国はすごいですね。これたぶん、ばっちり準備していました。というのも、韓国では数年前、MERSが流行して30人以上が亡くなっています。輸入症例だけでなく四次感染まで起きました。

2020-02-26 20:35:14

MERSウイルスの感染患者は2012年9月にサウジアラビアでが最初に報告され
https://www.forth.go.jp/keneki/kanku/disease/dis04_04mid.html
その後韓国で最初の患者(中東からの帰国者)が報告されたのは2015年5月20日のことでした。
https://www.forth.go.jp/keneki/kanku/info/2015/20150067.htm

以来36人の死亡を含む合計186人のMERS感染者を出した後
https://www.forth.go.jp/keneki/kanku/info/2015/20150172.html
終息宣言が出たのは現地時間で2015年12月23日24時のことです。
https://www.forth.go.jp/keneki/kanku/info/2015/20150207.html

名取宏(なとろむ) @NATROM

コロナウイルスによる疾患の代表がSARSとMERSです。韓国はMERSを教訓として準備していたのでしょう。日本では私の知る限りではMERSは発生していません。この差が、今回の新型コロナの対応の差にあらわれたのではないかと、個人的には思います。

2020-02-26 20:35:36
名取宏(なとろむ) @NATROM

「MERSの教訓で韓国は準備していた」は私の個人的な推測です。詳しい方がいらっしゃったら補足をお願いします。また、落ち着いたら検証がなされるべきです。ただ、少なくとも「韓国ができているに日本ができていないのは政府が感染者数を少なく見せたいから」という見方はあまりに単純すぎます。

2020-02-26 20:36:06
名取宏(なとろむ) @NATROM

いま保健所や地方衛生研究所を責めても問題は容易には解決しないかもしれません。長丁場になりそうなので、現場は不眠不休で頑張るのではなく、持続可能性に重きをおいて適切な休息をとってもらいたいと思います。批判の対象は現場じゃないです。陰謀論は現場の士気を下げます。

2020-02-26 20:37:07
名取宏(なとろむ) @NATROM

事前の準備不足が原因だった場合、陰謀論に安易に乗っかったり現場を責めたりすることは、問題解決につながらないばかりか、本当の責任の所在をあいまいにします。以上、長文でした。

2020-02-26 20:37:53
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