コロナ関連で読んだ論文等

medRxivとかbioRxivのようなプレプリントは、ひどい内容のものが多いので、分野外の人はスルーするのがいいと思います。
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ヨートゥーン @jotun82

仮に2019年末の段階で日本に入って来ていたとしても、集団免疫獲得するまでには相当時間がかかると思うんだが。

2020-04-10 21:14:45
ヨートゥーン @jotun82

やはりmedRxivはゴミ箱だな。読むだけ時間の無駄である。

2020-04-10 21:17:32
ヨートゥーン @jotun82

Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes pnas.org/content/early/…

2020-04-10 21:30:10
ヨートゥーン @jotun82

Virus strain of a mild COVID-19 patient in Hangzhou representing a new trend in SARS-CoV-2 evolution related to Furin cleavage site medrxiv.org/content/10.110…

2020-04-13 20:55:50
ヨートゥーン @jotun82

症状の軽い患者から単離したから弱毒株ってのは、ちと安易ではないか。

2020-04-13 21:00:29
ヨートゥーン @jotun82

さらっと読んでみたけど、症状の軽い患者から単離されたという以外に、弱毒であるという根拠はほとんどないようだ。(変異の位置からFurinへの結合性が低そうとかそういう考察はしてるが)

2020-04-13 21:09:39
ヨートゥーン @jotun82

COVID-19 Antibody Seroprevalence in Santa Clara County, California medrxiv.org/content/10.110…

2020-04-18 09:45:33
ヨートゥーン @jotun82

"Reports from the town of Robbio, Italy, where the entire population was tested, suggest at least 10% seropositivity; 24 and data from Gangelt, a highly affected area in Germany,25 point to 14% seropositivity."

2020-04-18 09:56:05
ヨートゥーン @jotun82

"A recent effort to test the town of Telluride, Colorado is underway, and interim results suggest a prevalence just under 2%. Our data from Santa Clara county suggest higher spread of the infection than Telluride but lower than some areas in Europe."

2020-04-18 09:56:26
ヨートゥーン @jotun82

粗陽性率で1.5%、人口調整すると2.8%の陽性率で、それまでの検査陽性者の数十倍はいそうとのこと。

2020-04-18 09:59:16
ヨートゥーン @jotun82

IgGとIgMで見てるけど、感度は6~7割程度で、特異度はかなり高そう。

2020-04-18 11:02:15
ヨートゥーン @jotun82

最終的な感染者の見積もりは2.5~4.2%で、人口調整した上でキットの感度の低さも加味してる。まぁ大雑把と言えば大雑把。

2020-04-18 11:03:45
ヨートゥーン @jotun82

この手の調査から国(世界)全体の感染率を見積もるのは厳しくて、せいぜい既存のPCR陽性者数の妥当性を見積もるくらい。(そして10~100分の1程度しか検出できてないという)

2020-04-18 11:07:39
ヨートゥーン @jotun82

病原体検出マニュアル > 新型コロナウイルス感染症 niid.go.jp/niid/ja/labora…

2020-04-18 15:16:56
ヨートゥーン @jotun82

「ウイルス排出量が多い場合、他の人に感染させる可能性が高くなる。このウイルス排出量は「重症度ではなく年齢に関係する」と押谷教授は語る。 … 中高年は青壮年に比べると、より感染させる力が高い可能性があり、高齢者の場合は中高年よりもさらに感染性が高いことが考えられる。」

2020-04-20 20:03:30
ヨートゥーン @jotun82

Temporal profiles of viral load in posterior oropharyngeal saliva samples and serum antibody responses during infection by SARS-CoV-2: an observational cohort study thelancet.com/journals/lanin…

2020-04-20 20:04:06
ヨートゥーン @jotun82

確かに年齢との相関は有意で、重症度での群間比較は有意でないけど、「高齢者の方が免疫力が弱いので重症化しやすくウイルス量も多い」くらいの話に思える。

2020-04-20 20:10:16
ヨートゥーン @jotun82

Nat Rev Immunolのワクチンのコメント読んでみたけど、旧SARSのワクチン開発は失敗の歴史だったようだ。

2020-04-22 19:51:48
ヨートゥーン @jotun82

しかしワクチン開発の一般的な戦略みたいなものが見えてこないんだけど、かなりの部分は試行錯誤しないとわからんということなのかね。

2020-04-22 19:55:11
ヨートゥーン @jotun82

モノクローナル抗体の方が有望ではみたいな話で締めてるけど、「数カ月のうちに世界中に行き渡る」ってのは無理があると思う。

2020-04-22 20:10:43
ヨートゥーン @jotun82

新型コロナウイルス:SARS-CoV-2の感染を阻害し中和するヒト・モノクローナル抗体を作出 - crisp_bio crisp-bio.blog.jp/archives/22244…

2020-04-22 20:13:23
ヨートゥーン @jotun82

モノクローナル抗体による病原体の中和って、実用化された例があるんだろうか。

2020-04-22 20:15:02
ヨートゥーン @jotun82

ADEの話が中心で、かなり基礎寄りという印象を受けた。

2020-04-22 20:20:58
ヨートゥーン @jotun82

これの話ね。 The potential danger of suboptimal antibody responses in COVID-19 nature.com/articles/s4157…

2020-04-22 20:22:40