mbsj2013 4AW2-4

日本分子生物学会2013 4AW2-4 ワークショップ 「DBCLSのサービスを利用したDIYデータベースの構築について」 についてまとめました 発表スライドはこちらです http://www.slideshare.net/HiromiKanegae/mbsj20134-aw2
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猫教授 @yaskaz

@iNut 後半は柔らかいネタですよみなさん〜 #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:07:07
猫教授 @yaskaz

まずはナマモノ、ホウライシダのご紹介から #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:20:09
猫教授 @yaskaz

非モデル生物のDBがないなら、DIYしましょう #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:22:16
so @synobu

シダEST解析とKAASによる自動アノテーション, TogoDB, LSDB Archive を利用したデータベース公開の実例. AcEST. http://t.co/S9sJypiESi #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:25:21
Nakazato T. @chalkless

このコマ、ムービーで見せるワザが多いですね。インパクトある。#4AW2 #mbsj2013

2013-12-06 10:26:28
meso_cacase @meso_cacase

プログラミング未経験であっても、統合TVや統合データベース講習会の資料で勉強してデータベースをDIYできる #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:28:18
so @synobu

ツールの利用法やセットアップは, TogoTVや統合データベース講習会のコンテンツで勉強した. #4AW2

2013-12-06 10:28:29
小野 浩雅 ONO, Hiromasa @h_ono

ライフサイエンス分野のデータベース統合を担う人材AJACS(All Japan Annotator/Curator/System DB administrator) 向けの教材を提供しています。 http://t.co/w42rZQuCn6 #mbsj2013 #4WA2

2013-12-06 10:31:30
meso_cacase @meso_cacase

TogoDBは、誰でも簡単にデータベース構築が可能で、複合検索など基本的な機能がすぐに利用できるDBCLSのホスティングサービス http://t.co/wZZOOaAdsw #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:32:01
so @synobu

OpenRefineからKEGG APIをたたく方法 #mbsj2013 #4WA2

2013-12-06 10:32:52
猫教授 @yaskaz

Google スプレッドシートだと上限がありますので大量ならばOpenRefine #4AW2

2013-12-06 10:33:25
猫教授 @yaskaz

つぶやき禁止のホットなデータ登場 #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:36:36
小野 浩雅 ONO, Hiromasa @h_ono

Excelにはないさまざまな機能を持つOpen Refineと、TogoWS RESTを用いて、大量の遺伝子IDに関連するアノテーションを一括取得する方法を紹介していますhttp://t.co/pC9coX1NTN #mbsj2013

2013-12-06 10:36:58
so @synobu

EST解析とDIYで作ったデータベースを使って比較ゲノム解析を行って植物の形態形成に重要な遺伝子を発見. データを公開することで共同研究の可能性も拡がる. #mbsj2013 #4AW2

2013-12-06 10:38:22
hkane @hkanekane

DBを作るまでに、どれくらい時間がかかりましたか?と聞かれたけど、他の仕事をいくつもかけもちしながら1年くらい データをどのような視点で解析するか?そのために必要な技術は何か? 自分で解析するにはどのツールが良いか? を試行錯誤するのに時間がかかる 作業自体はあっという間

2013-12-07 17:29:08
オープンデータ推進者なので情報共有しない鍵垢はフォロー解除するぼうのうひでまさ @bonohu

WSの影響?2位もOpen Refineだし QT @togotv_bot: 昨日の再生数ランキング1位> 高速配列検索 GGGenome《ゲゲゲノム》の使い方 統合TV (togotv)(2013-10-25) http://t.co/HnyiYDqhpg #togotv

2013-12-07 21:35:50
hkane @hkanekane

TogoDBの使い方 ~自分のデータベースを作る~ http://t.co/i2koUaQnJ2 Local BLAST の使い方~導入・準備編 (MacOSX版)~ 2011 http://t.co/CUrPU3ADFC を紹介しました #4WA2 #togotv

2013-12-09 23:18:41
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hkane @hkanekane

TogoWS RESTサービスを使い倒す http://t.co/3ZYmU7LldJ … Open Refineの使い方〜応用編・TogoWS RESTを活用する http://t.co/5b9z6zKIuF を紹介しました #4WA2 #togotv

2013-12-09 23:24:08
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