生命医薬情報学連合大会 #IIBMP BoF 「Museomicsが開く新時代」

とりいそぎツイートを集めました。編集可です。
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Ikemen Mas Kot @maskot1977

枯葉に擬態する蝶は、どうやって進化したか? #iibmp

2016-10-01 11:04:47
Utsugi JINBO @mothprog

Museomicsの実践例その1: 蝶の枯葉擬態斑紋パターンの進化 #iibmp

2016-10-01 11:06:31
Ikemen Mas Kot @maskot1977

1、分子進化学で、遺伝子情報から系統樹を作成 2、形態学で、画像情報から特徴量を抽出 3、1と2を組み合わせて系統比較し枯葉擬態模様の進化を探る #iibmp

2016-10-01 11:06:59
Haruo Suzuki @copypasteusa

#IIBMP 鈴木誉保(農研機構)Museomicsの実践例(1)枯葉模様の進化 jsbi.org/iibmp2016/prog… Suzuki et al. 2014 BMC Evol Biol. ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25421067

2016-10-01 11:07:02
Utsugi JINBO @mothprog

たしかに画像イメージをまとめてダウンロードできるような標本写真データベースは聞いたことが無いなあ。オープンデータなのも少ないし。 #iibmp

2016-10-01 11:12:12
Ikemen Mas Kot @maskot1977

@mothprog 手動ダウンロードで2週間ってのはしんどいですね。 #iibmp

2016-10-01 11:13:17
Haruo Suzuki @copypasteusa

#IIBMP 形態学:グラウンドプラン 画像情報+形態学;Character coding ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…

2016-10-01 11:15:11
Utsugi JINBO @mothprog

画像解析が行える程度の精度を持った画像データベースもまた少ない。 #iibmp というか、そういうニーズまで思い至っていない。

2016-10-01 11:15:34
Utsugi JINBO @mothprog

Modern Phylogenetic Comparative Methods and Their Application in Evolutionary Biology springer.com/us/book/978366… #iibmp

2016-10-01 11:16:47
Utsugi JINBO @mothprog

Suzuki et al., 2014 Gradual and contingent evolutionary emergence of leaf mimicry in butterfly wing patterns ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25421067 #iibmp

2016-10-01 11:18:21
Ikemen Mas Kot @maskot1977

形質変化の順序まで推定できるのか、、、 #iibmp

2016-10-01 11:18:26
Ikemen Mas Kot @maskot1977

静的なデータ→動的なデータ #iibmp

2016-10-01 11:19:50
Ikemen Mas Kot @maskot1977

大陸移動と古生息域の推定 #iibmp

2016-10-01 11:20:23
Ikemen Mas Kot @maskot1977

網羅的・大規模な種数を利用した解析 #iibmp

2016-10-01 11:21:19
Utsugi JINBO @mothprog

Claramunt and Cracraft 2015 A new time tree reveals Earth history’s imprint on the evolution of modern birds advances.sciencemag.org/content/1/11/e… #iibmp

2016-10-01 11:23:42
Haruo Suzuki @copypasteusa

#IIBMP 系統比較法 Modern Phylogenetic Comparative Methods and Their | László Zsolt Garamszegi | Springer springer.com/la/book/978366…

2016-10-01 11:23:54
Utsugi JINBO @mothprog

Oliver et al. (2014) Nymphalid eyespot serial homologues originate as a few individualized modules rspb.royalsocietypublishing.org/content/281/17… #iibmp

2016-10-01 11:25:01
Utsugi JINBO @mothprog

日本の博物館にも(バイオ)インフォマティシャンほんと欲しい #iibmp

2016-10-01 11:28:15
Ikemen Mas Kot @maskot1977

博物館資料をシーケンスすることによって新規発見につながりそうな例 #iibmp

2016-10-01 11:28:17
服部@転職しました @emi_2sheds

奈良先武藤先生:英米では博物館でのバイオインフォマティシャン雇用が始まっているとのこと #IIBMP 博物館で働くのいいなあ

2016-10-01 11:29:04
Utsugi JINBO @mothprog

Museomicsの実践例その2:蝶の食草変換メカニズム #iibmp

2016-10-01 11:30:46
Ikemen Mas Kot @maskot1977

Museomics のセッション進行がけっこう遅れている。 #iibmp

2016-10-01 11:31:16
Utsugi JINBO @mothprog

KNApSAcK A Comprehensive Species-Metabolite Relationship Database kanaya.naist.jp/KNApSAcK/ #iibmp

2016-10-01 11:35:45
Utsugi JINBO @mothprog

参考:ぼくが手伝ったの日本産チョウ類寄主植物のデータペーパー Saito et al. 2016 Larval host records of butterflies in Japan link.springer.com/article/10.100… #iibmp

2016-10-01 11:36:52