- 1123Onlooker
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きっかけはこのツイートです。
この方は東京農業大学卒でこういった分子生物学は経験があるそうです。
PCRはさんざんやりましたが、PCR増殖法の特性上「偽陰性」は多く出ても「偽陽性」はほぼ出ませんよ。無いものは増殖できませんから、当たり前。また、二番目で既に間違い。陽性なら症状出るまで自宅隔離です。ここは孫さんも厚労と連動とはじめからはっきり言ってるから。 twitter.com/koshian/status…
2020-03-12 03:00:47孫正義が簡易PCR検査を無償で実施 ↓ 偽陽性や軽症者が病院に押し寄せる ↓ 偽陽性でも隔離せざるを得ない ↓ 隔離用の病床が埋まる ↓ 医療機関のキャパシティを超える ↓ 重症者が治療を受けられなくなる ↓ コロナウイルスによる死亡者が増える これまで出てきた情報を総合するとこうなるとしか…
2020-03-11 19:15:31検査で陽性検体も扱ってたらそこら中にアンプリコンいるじゃん twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 12:23:47いきなり攻撃的です。
とりあえず、原稿書く。返事しなくて勝利宣言とか出るんだろうな、駄目な医者って仕事振られずに暇だから。。。
2020-03-12 14:57:31「原稿書く」と書き込んだとたんにアカウント増やして質問攻め開始するアホをまともに相手にするわけ無いだろうに。
2020-03-12 15:14:01@pstar7bob @Omg69bwO @pochi37564 原稿中話しかけたらブロックと宣言済みですので、そのように致しますね。
2020-03-12 16:31:15誰かアカウント増やして攻撃した?
primerとtemplateの結合は単なる水素結合の連続ですのでは配列が異なっていても一定程度の確率で非特異的に結合します。templateの配列多様性が低ければ偽陽性の可能性は低く、多くの人がやったことのあるPCRはそういった「綺麗な」PCRでしょうが、今回のような環境サンプルのtemplateは純度も低く(続 twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 16:50:26患者本人の細胞由来のRNAなどを含むため配列の多様性も高いので偽陽性が出る可能性は飛躍的に高まります。さらにいえば、検査を受ける=風邪の症状が出ている、ということはなにがしかのウイルスに感染している可能性が高いわけで、その場合その原因となっている(続) twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 16:50:27SARS-CoV-2以外のウイルス(多くの風邪はコロナウイルスだと言われていますね)が、用いているprimerと異なれど近い配列を持っていた場合には偽陽性はさらに高まりますね。重要なのは、我々は世界に存在する全てのウイルスの配列を知っている訳ではないので(続) twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 16:50:27ひょっとしたら全然関係ない普通の風邪をひきおこすコロナウイルスがなんらかの偶然で比較的似た配列をもっていてその結果偽陽性になることはありますね。S型とL型とで症状が違うという論文が正しいならば、そういうことも大いにあり得そう。(続) twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 16:50:27ですので、「PCRは原理上偽陽性はほぼ出ない」「ないものは増やせない」というのは真実ではない、と言えます。プロコトル見るとnested PCRあるいはtaqMan probe使うかして、場合によってはサンガーもかけるなどしてかなり丁寧に偽陽性を抑える努力はされてるなと感じますが。 twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 16:50:28ちなみに僕はウイルスではなくバクテリアで、ストレイン特異的なプライマーやバクテリアならなんでも増えるプライマーなんぞを使ってPCRすることがよくありますが、増えるはずのないストレインで増えたりテンプレートを入れてない水サンプルで謎に増えたりなんてことはまぁしょっちゅうに起こります。
2020-03-13 16:53:48このNakano博士はPubMedで調べると、論文を10本近く国際誌に発表している研究者です。いわばプロです。
その方に対する回答はこれ。
@LuckyStrike1984 まあそうです。類似のウイルスは出ますし、コンタミも同然にします。なので複数回検査や抗体検査と組み合わせるわけですし。さて、原稿の邪魔をしたので宣言通りに一律ブロックしますね。
2020-03-13 16:56:26若い諸君は、「無いものは増殖できませんから、当たり前」というような研究者にはならないようにしてくださいね。Organized skepticismが我々のethosですよ。 twitter.com/tezukakaz/stat…
2020-03-13 17:18:07深夜の正規分布おじさん騒動は一部の人には印象深い出来事でした。
またあえて嬉しいです、おじさん。
PCRと偽陽性ですが、おじさんは匿名がキライ、実名が好きですので、実名らしきものでやっている人のコメントを掲載します。
ハーバード大の山形博士です。当然業績多数、ガチガチのプロです。