COVID-19のPCR検査偽陽性について【検査の性質を知り、結果を読む力を持てば、偽陽性は生じない】(2020.11.4作成) #内村航平

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Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

怒濤の9連勤が終わった。ここを完全放置している間にも偽陽性報道があったりして、世の中は動いているなぁ、と。 発熱外来は忙しくなってきた。他所でも同じことが起こっていると思うが、「糖尿水虫4日前から足パンパン発熱」とか明らかにCOVIDじゃない例が混じる。でも入院にするなら全例PCRする。

2020-11-03 18:47:31
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

週間ひとりごとメルマガみたいになっているが、前号は東大医科研からの「N95マスクでも10%ものウイルスが通過する」という衝撃の研究結果に触れて終わった。 「そうするとまさに空気感染じゃないの?」という方向に議論が広がるかと思いきや、そうでもないのが世の中の不思議。

2020-11-03 18:54:47
リンク 共同通信 マスクに拡散と吸い込み抑制効果 コロナで装着実験、東京大など | 共同通信 マネキンにマスクを装着して新型コロナウイルスがどの程度マスクを通過するか調べる実験で、ウイルスの拡散... 2
リンク NHKニュース マスクでウイルス拡散抑え吸い込み減らす効果 東京大など確認 | NHKニュース 【NHK】新型コロナウイルス対策としてマスクを着用すると、ウイルスの拡散を抑える効果と吸い込むウイルスを減らす効果の両方の効果があ… 552 users 2869

Effectiveness of Face Masks in Preventing Airborne Transmission of SARS-CoV-2 | mSphere https://msphere.asm.org/content/5/5/e00637-20

SARS-CoV-2の空中伝播の防止におけるフェイスマスクの有効性

Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

飛沫のサイズと滞空時間を理解するうえで分かりやすいのは下記リンクの室内環境学会のまとめ。一読の価値あり。 siej.org/sub/sarscov2v1… pic.twitter.com/pOThWhm9kV

2020-11-03 18:59:40
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Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

コメントで御紹介いただいた動画がN95マスクの特殊性について非常にわかりやすく説明してくれているのでリツイで御紹介。 NewYorkTimesの動的サイトよりも良いと思う。spider webの表現は秀逸。 twitter.com/tossact/status…

2020-11-03 19:08:07
toss ★緊急事態条項はトロイの木馬、憲法停止ウイルス! @tossact

@kakeashi_ashika 一般の人向け つ N95マスクの驚異的な物理学 youtu.be/eAdanPfQdCA @YouTubeより (日本語字幕選択できる)

2020-10-26 06:41:31
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

ここからCOVIDのPCR偽陽性をどう考えるか、について展開したい。 同業者向けの平易でない書き方になること、長文ダラダラになることをあらかじめお断りしておく。

2020-11-03 19:12:55
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

このアカウントは本来、同志である医療系有資格者、中でも医者をターゲットと見据えて、院内防疫すなわち医療機関の水際対策とスタッフ感染防止に寄与する検査とマスクについて、私のこれまでの学びを還元する目的で運用している。(続く

2020-11-03 19:27:56
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

承前)ここからは医療実務や生物科学になじみのない方に不親切な書き方をするが、どの業界にもあるように共通基盤となる教育や知識がある。噛み砕いて説明することで本来のターゲットに意図したニュアンスで伝わらないことは、最も避けたいところなので御容赦いただきたい。

2020-11-03 19:27:56
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

同志である先生方へのメッセージ(その1/4) 1-①「PCR偽陽性」報道を受けて、戸惑っておられる先生方、それみたことかと鬼の首を取ったようなお気持ちの先生方、いずれの立場の先生方にも、いま一度、ニュートラルな感情で考えていただきたい。

2020-11-03 20:25:55
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

1-②検査推進論者であろうと抑制論者であろうと、医者であるからには目指す方向は人類の健康な未来という点で全世界共通だと信じている。だからこそ、医者へのメッセージとして、医者のコトバで、お話ししようと思う。 合言葉は "Think wisely” だ。

2020-11-03 20:25:55
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

1-③マクロの視点(社会防疫)からお考えの先生と、ミクロの視点(診療)からお考えの先生がおられると思う。私はミクロの視点に立つが、院内の水際対策、というより自分が感染しないことを最優先に考える利己主義者である。

2020-11-03 20:25:55
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

1-④私は、大学3年次から院生→PD→助教で大学を出るまでの18年間のうち、6年次と学外病院修練4年間と院生1年目の病棟dutyの計6年のブランクを除く実質12年間、基礎研究室に身を置かせていただいた。

2020-11-03 20:25:56
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

1-⑤特にPD以降は患者さんに失礼のないよう、と言えば聞こえが良いが、過誤を恐れて臨床医としての技量維持に努めたため、ラボワークと診療を並行して本当に週の実働時間が100時間を超えていた。(最後の2年は助教のまま臨床講座にスライドしたが実験は継続)。

2020-11-03 20:25:56
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

1-⑥発現定量についてはノザンに代わる手法としてTaqMan方式の蛍光プローブのリアルタイムPCRを学部生時代に始め、かなりの時間をこれに割いた。試薬・機器サプライヤーのテクニカルアドバイザーや分子生物学畑の方と意見交換できるくらいには、やり込んだと思っている。

2020-11-03 20:25:56
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

1-⑦私が研究を離れてからそれなりの時間が経つが、蛍光プローブのリアルタイムPCRの原理は変わっていないと理解している。 そのうえで、改めて先生方にお伝えしたい。鋳型が存在しないのにきれいな増殖曲線が立ち上がるという「本当の意味での典型的な偽陽性」を出すことはきわめてきわめて難しい。

2020-11-03 20:25:57
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

同志である先生方へのメッセージ(その2/4) 2-①内村選手の「偽陽性」報道を見るに、我が国の科学的リテラシーの問題を改めて考えさせられた。リテラシーについては8月の再掲。 一般の皆様の多くが、二つある段階の一つ目のLiteracy in Scienceでつまづいてしまっている。 twitter.com/kakeashi_ashik…

2020-11-03 21:30:20
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

「科学的リテラシー」は厳密にはふたつの意味を含む。下記オーストラリアのビクトリア州の教職向けのサイトが分かりやすい。 図の核にあるLiteracy in Scienceは科学的な文章を読み書きする能力。たとえば、"weight"と"mass"は日常生活では互換だが(続く education.vic.gov.au/school/teacher…

2020-08-22 21:53:52
まとめ 内村航平選手 PCR検査で陽性後、別の検査会社で陰性。最初の検査で陽性となった原因を検証する事が必要(2020.11.. 理論上、PCR検査で偽陽性は無い。 あるとすると「コンタミ」。 そして検査時は「陽性」。その後、PCR検査で「陰性」になったとしたら、最初PCR検査以前は「陽性」と言う事を意味する。 2721 pv 16
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

2-②「偽陽性」という用語は「異常である事実はないのに異常と判定すること」を意味するはずである。これを今般の新型コロナの検査に適用するなら「ウイルスが存在しないのに検出したという結果が出ること」ということになる。

2020-11-03 21:30:21
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

2-③ところが、PCRの遅いサイクルでシグナルが出る(Ct値が大きい)ことを「偽陽性」と呼称する人たちが少なくない。Ct値が大きいことは、反応系に持ち込まれる鋳型核酸の量が少ないことや夾雑物による反応抑制を反映するが、※キレイな増殖曲線が得られたのであれば※ウイルスの存在は間違いない。

2020-11-03 21:30:21
Cheeman M.D.,Ph.D. @kakeashi_ashika

2-④たとえ微量のウイルスでも「キレイに」検出できたのであれば、紛う事なき陽性である。検査としては正常に機能している。これを偽陽性と言ってはならない。先生方ならお分かりいただけるはず。

2020-11-03 21:30:21
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