編集部イチオシ

AlphaFold2座談会

AlphaFold2の有識者による座談会がtwitterのスペースで行われた。これは、7/22(水)のハッシュダグ#AF2zadankai #Alphafold座談会 をまとめたものになります。 @Ag_smith さんを中心に、5人のスピーカーが背景となる研究内容から、AlphaFold2の大まかな仕様、実用性について解説などがあった。参加者は最大700名を超え、AlphaFold2の革新性と注目度が窺える。 今後は、discordなどを通じてAlphaFold2に関する意見交換を行なっていくそうなので、興味のある方はご参加ください。 AlphaFold2解体新書: https://www.af2anatomia.jp/ @tonets さんのCASP14のまとめ: https://togetter.com/li/1630461
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mind uploading @Yasufumi_Nakata

系列をどうにかする→アテンションの誕生。 #Alphafold座談会

2021-07-21 22:47:39
不限春眠不覚暁 @zampona_x31

#Alphafold座談会 機械翻訳の核技術が転用されている。代表例は DeepL など 翻訳の分野では文が長くなると、個々の単語が「薄まって」しまい、文全体の中で訳文に「効く」のがどこかよく分らなくなる => 単語列全体を上手くコーディングする方法が模索され単語間の関係をコードしよう

2021-07-21 22:48:24
不限春眠不覚暁 @zampona_x31

#Alphafold座談会 Self attention : 自己系列の中での単語間相関をとろう => 上手くいった => ほかの分野でも使えるのでは? Attention is All You Need. => 画像認識でも成功 Alphafold2 自体が開発された時点では今ほど transformer 無双だったわけではないことは注意(後追いというわけではない

2021-07-21 22:50:39
富谷(大学助教)物理学会論文賞/監修シン仮面ライダー @TomiyaAkio

構造生物学、すでにアテンションが一般的なのか 理論物理だと聞かないなぁ #AF2zadankai

2021-07-21 22:50:48
きつね・R・ @statistic_fox

NGS屋としてはタンパク質構造予測に機械学習が使われ、Variant Callingにも機械学習が使われ、 そのうちマッピングとかアセンブルとかにも使われるようになるのかなあと思ったり思わなかったり #AF2zadankai

2021-07-21 22:51:54
不限春眠不覚暁 @zampona_x31

#Alphafold座談会 Evoformer: 3用途 3-a. row-wise-gated-self-attention 一つのアミノ酸配列内の残基間の結びつきの強さを推定

2021-07-21 22:52:18
mind uploading @Yasufumi_Nakata

配列を突っ込んでそれをみていい感じに予測する。その後にさらにアテンション。 #Alphafold座談会

2021-07-21 22:52:35
不限春眠不覚暁 @zampona_x31

#Alphafold座談会 3-b.column-wise-gated-self-attention: 複数の類縁配列間で、相同に見える残基を抽出しているように見える

2021-07-21 22:53:15
かくびー @cakkby2

Attentionってほんとに凄いんだな PRMLとか理情3Aの知能システム論で深層学習ある程度やった後に勉強する! #AF2zadankai

2021-07-21 22:53:26
やまを @levinthal_prdx

これattentionだけじゃなくてgateも付けたり2残基間の関係性を補強するためにペア表現からも重みを引っ張ってきたりいろいろ工夫されてて本当に熱いんすよ #AF2zadankai

2021-07-21 22:53:46
不限春眠不覚暁 @zampona_x31

#Alphafold座談会 3-c. triangle-update: 幾何学的制約条件を実現しているattention なのかな????

2021-07-21 22:54:18
tshykd @tshykd

わかりやすい説明でAttention理解した気になった #AF2zadankai pic.twitter.com/LwCuDkGX8q

2021-07-21 22:54:49
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