“分子を見たい！” 新分子ビューアGLmolの誕生と成長
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shinodatter
@shinodatter
@biochem_fan はい、プロキシ的なCGIです。外部サイトに設置する時はyoutubeの埋め込みコードの様にiframeを利用してはいかがでしょう？（利用者があまり多いとサーバーが重くなりますがPDBファイルを通過させるだけであればきっとそれほどまでは・・）
2011-10-17 00:25:03
... ..
@32nm
RT @biochem_fan: http://t.co/JyNtEdbk > WebGL による分子ビューア. 蛋白質のPDBファイルを読み込んで主鎖を曲線で表示できるようにしたものを公開。 @magic_kanata
2011-10-17 00:41:33
Kozo Nishida | 西田孝三
@kozo2
RT @biochem_fan: http://t.co/JyNtEdbk > WebGL による分子ビューア. 蛋白質のPDBファイルを読み込んで主鎖を曲線で表示できるようにしたものを公開。 @magic_kanata
2011-10-17 00:45:49
baramonia
@baramonia
おおっRT @biochem_fan: http://t.co/9HZ57iJU > WebGL による分子ビューア. 蛋白質のPDBファイルを読み込んで主鎖を曲線で表示できるようにしたものを公開。 @magic_kanata
2011-10-17 01:03:30
kiyoshikanata
@kkanata
RT @biochem_fan: http://t.co/JyNtEdbk > WebGL による分子ビューア. 蛋白質のPDBファイルを読み込んで主鎖を曲線で表示できるようにしたものを公開。 @magic_kanata
2011-10-17 01:04:18
antisense.
@razoralign
RT @biochem_fan: http://t.co/JyNtEdbk > WebGL による分子ビューア. 蛋白質のPDBファイルを読み込んで主鎖を曲線で表示できるようにしたものを公開。 @magic_kanata
2011-10-17 01:32:37
とりさん
@biochem_fan
WebGL による分子ビューアは Javascript で書いてるわけだから、描画部分だけ差し替えれば Flash にも移植できるはずだ。将来的には、3D に対応した Flash 11 版も作って、パフォーマンスの比較とかやってみたい。
2011-10-17 08:06:04
とりさん
@biochem_fan
昨日公開したWebGLによる分子構造ビューア http://t.co/JyNtEdbk は、新たにPymolでいうところのstick表示とline表示を実装した。表示の平行移動も実装。現在、内部でのデータモデルを改良中。jsdo.it にあるものは、これが済んだら更新予定。
2011-10-17 20:40:11
Kozo Nishida | 西田孝三
@kozo2
RT @biochem_fan: 昨日公開したWebGLによる分子構造ビューア http://t.co/JyNtEdbk は、新たにPymolでいうところのstick表示とline表示を実装した。表示の平行移動も実装。現在、内部でのデータモデルを改良中。jsdo.it にあるものは、これが済んだら更新予定。
2011-10-17 20:40:47
とりさん
@biochem_fan
ちょ、PDB の ATOM と HETATM は、レコード名が違うだけで、後は同じじゃないか! がんばって、別々にパーサを書いてたぞ(汗)
2011-10-17 20:46:14
とりさん
@biochem_fan
データモデルの変更により、特定の残基だけ表示方法を変更できるようになった。次の課題は、回転中心の移動、鎖ごとの着色、UI。そして、cartoon 表示にとりかかりたい。
2011-10-18 00:55:23
Hot Codes Bot
@hot_codes_bot
GLmol - proof of concept version: Web GL で実装した低分子ビューア。 本格的な用途には Chime とか… http://t.co/afEsCvX5 #jsdoit hot code
2011-10-18 10:04:45
とりさん
@biochem_fan
http://t.co/oCZUIeKC > WebGL による分子構造ビューアをバージョンアップしました! Pymol でいう ribbon, stick, sphere, line 表示に対応。color by chain に対応。マウス操作で回転・並進・拡大縮小が可能。
2011-10-18 20:45:02
とりさん
@biochem_fan
@magic_kanata ありがとうございます。内部データ構造の改良と回転中心の移動という二つの難所を超えて、一息ついたところです。 Cartoon 表示に向けた作業にも、いよいよとりかかろうと思っています。
2011-10-18 20:52:55
shinodatter
@shinodatter
Web用軽量分子構造ビューアがすごく快適で感動しました！ GLmol - preAlpha version #jsdoit http://t.co/KfyWI5VN
2011-10-18 21:20:31
kiyoshikanata
@kkanata
RT @biochem_fan: http://t.co/oCZUIeKC > WebGL による分子構造ビューアをバージョンアップしました! Pymol でいう ribbon, stick, sphere, line 表示に対応。color by chain に対応。マウス操作で回転・並進・拡大縮小が可能。
2011-10-18 21:24:51
K. Yam
@yam_cpp
RT @shinodatter: Web用軽量分子構造ビューアがすごく快適で感動しました！ GLmol - preAlpha version #jsdoit http://t.co/KfyWI5VN
2011-10-18 22:16:23
とりさん
@biochem_fan
今作ってる WebGL による分子ビューア http://t.co/oCZUIeKC は、高機能化して Jmol などの代替を目指すのではなく、軽快に動くことを第一にしたいと思っている。あと、単なるデモでない、WebGL/Javascript の実用的な使用例となりたい。
2011-10-18 22:27:44
kyo_ago
@kyo_ago
RT @biochem_fan: 今作ってる WebGL による分子ビューア http://t.co/oCZUIeKC は、高機能化して Jmol などの代替を目指すのではなく、軽快に動くことを第一にしたいと思っている。あと、単なるデモでない、WebGL/Javascript の実用的な使用例となりたい。
2011-10-18 22:31:28
ながびん
@nagabin
RT @biochem_fan: 今作ってる WebGL による分子ビューア http://t.co/oCZUIeKC は、高機能化して Jmol などの代替を目指すのではなく、軽快に動くことを第一にしたいと思っている。あと、単なるデモでない、WebGL/Javascript の実用的な使用例となりたい。
2011-10-18 22:34:37