ラン藻の分子生物学 2011
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so
@synobu
シアノバクテリアのモリブデン補因子の生合成系の解析. 白石先生（京大）硝酸還元酵素など多くの酵素がモリブデン補因子をもっている. #cyanows2011
2011-12-02 17:23:18
so
@synobu
「基調講演：ラン藻ゲノム研究の誕生、発展、今後の展開」田畑先生（かずさ） 機能を知るには, まず構造を知れ. 1993年4月千葉市農業大学校内仮設研究所で設立. 当初ヒトゲノムのcDNAのシーケンスがメインだったが, 成果の目玉としてシアノを. #cyanows2011
2011-12-03 09:06:24
so
@synobu
新規技術は生物学を発展させる. バイオインフォマティクスに根拠のない過度な期待は禁物. 基礎研究にとどまるのは自己完結的. 専門外の研究者や一般の人たちに向けて将来の大きな夢を. #cyanows2011
2011-12-03 09:30:22
Utsugi JINBO
@mothprog
RT @synobu: 新規技術は生物学を発展させる. バイオインフォマティクスに根拠のない過度な期待は禁物. 基礎研究にとどまるのは自己完結的. 専門外の研究者や一般の人たちに向けて将来の大きな夢を. #cyanows2011
2011-12-03 09:33:32
so
@synobu
コメント: 現在リシーケンスしても3.6 Mbpで20 bpくらいしかまちがいがない. 当時のシーケンス技術の正確さが忍ばれる. #cyanows2011
2011-12-03 09:45:28
NK
@4n3a
RT @synobu: 新規技術は生物学を発展させる. バイオインフォマティクスに根拠のない過度な期待は禁物. 基礎研究にとどまるのは自己完結的. 専門外の研究者や一般の人たちに向けて将来の大きな夢を. #cyanows2011
2011-12-03 09:58:27
sum_ichi
@sum_ichi
RT @synobu: ゲノム解読は高精度から概要へ. リファレンスから多様性へ. モデル系から環境へ. #cyanows2011
2011-12-03 10:00:27
so
@synobu
「原核生物の次世代遺伝学」井原先生（名大）3-6 Mbのゲノムサイズに生き物の本質があるのではないか. 現象の解析には順遺伝学が重要だが, 原核生物ではそれがコスト低く出来る時代になった. #cyanows2011
2011-12-03 11:18:04
so
@synobu
「なんとかなるゲノム」5 Mbp, 3000 genes くらいの生き物. リシーケンス: 0.5Gb/株 (x100) 2万円. トランスクリプトーム. 3千万タグ/条件 1.5万円くらい. #cyanows2011
2011-12-03 11:44:25
so
@synobu
「提案：藍藻研究者間での新規ゲノム配列の共有化」広瀬さん（豊橋技術大）趣味で, そのへんから採ってきたシアノバクテリアの補色適応を見ていた. おもしろそうなのでNGSでドンドン読んだ. みなさんもドラフト配列をコミュニティで共有しませんかという提案. #cyanows2011
2011-12-03 11:52:23
so
@synobu
サンプル調製6時間 X 3日くらい. 454 GS FLX+でドラフトシーケンスまで簡単にできた！環境中から採取したサンプルで見たい遺伝子情報はすぐに見られた. 自分だけでは使い切れない. 各研究者がシーケンしたうunpublishな配列を共有しませんか？#cyanows2011
2011-12-03 11:58:02
so
@synobu
意見：コミュニティで囲い込む意味は？公共のデータベースではだめなの？答え：あまりオープン性を全面にだすとデータが出てこなくなるのではないか. クローズとオープンの中間くらいの仕組みが必要だと思う. #cyanows2011
2011-12-03 13:20:55
Utsugi JINBO
@mothprog
RT @synobu: 意見：コミュニティで囲い込む意味は？公共のデータベースではだめなの？答え：あまりオープン性を全面にだすとデータが出てこなくなるのではないか. クローズとオープンの中間くらいの仕組みが必要だと思う. #cyanows2011
2011-12-03 13:22:50
Utsugi JINBO
@mothprog
RT @synobu: カルチャーコレクションなどモノにアクセスできることと, 情報にアクセスできることの両方が大事. #cyanows2011
2011-12-03 13:23:02