第11回日本分類学会連合公開シンポジウム「種の記載の現場に迫る」まとめ
線虫の推定種数は50万から2億種ほどまで。既知種は25000から30000種。同じく分類学会連合で行った生物種数調査ではこんなでした: http://t.co/pNwqu6QS #ujssb
2012-01-07 14:19:52#ujssb 線虫の場合,推定種数は「50万〜2億」.(そもそも「種数」の推定値って,いったい……)
2012-01-07 14:19:53#ujssb 記載分類学は何の役に立つのか.「目的」なんかあらへん(という伏字).(マニアやコレクターでええのんちゃうの?)
2012-01-07 14:32:47#ujssb (承前)関心のある分類群については同定能力は確かに高いけど,興味のない分類群には見向きもしないというタクソノミストたちの“性向”がときには大きく問題になるらしい.
2012-01-07 14:34:25#ujssb 最近は molecular profile を記載文に付けることもある.
2012-01-07 14:37:37線虫のメジャーな雑誌であるNematology誌では、molecular profile(DNA情報)が必須事項に。 #ujssb
2012-01-07 14:38:47Molecular profileはDNAバーコードじゃないのね。たしかどこかでユニバーサルプライマーがうまくかからないことがあると聞いたような。
2012-01-07 14:39:44#ujssb インベントリーをつくるという記載分類の目的に照らすと,楽観的に見ても100年以上はかかる(推定種数が50万として).どうすんねん.分子マーカーを利用しつつ,functional diversity に基づく優先順位付け.
2012-01-07 14:40:52#ujssb DNA barcoding とかリバース・タクソノミーによる MOTU(molecular OTU)の記載という道筋.
2012-01-07 14:42:00と書いたら、DNAバーコードの話になった。環境DNAからのバーコードの蓄積、DNAバーコードで認識されたクラスター(MOTU、いまだとBINか)の記載、を組み合わせたアプローチ。 #ujssb
2012-01-07 14:42:15話が出てきた。線虫で使えるユニバーサルプライマーがなく、一番適用での範囲が広いプライマーはごく短い配列しか増やせない。 #ujssb
2012-01-07 14:44:55#ujssb 質疑:上島Q「分類学者はコンプリート欲望がある.線虫はぜったいムリだけど,モチベーションをどう保つか?」 形態的なおもしろさに浸る快楽.
2012-01-07 14:49:11#ujssb 上島Q「リバース・タクソノミーって将来があるのか?」 しつこくやるしかない.
2012-01-07 14:50:21#ujssb 「分類群への偏愛について」 好き嫌いは確かにある.「歯」のある線虫にはぞくぞくする.
2012-01-07 14:51:13