「糖鎖インフォマティクスシンポジウム」つぶやきまとめ
例によって例のごとく私自分用まとめ。ハッシュタグglycoinfoの発言に、その周辺の人のつぶやきを少し足し引きし...たはずなのですが、まだ過不足あるかも知れません。編集自由です。シンポジウムのページはこちらから http://www.rings.t.soka.ac.jp/symposium/
Maori Ito
@maoringo
ウエットの研究室にいると実験者と話をして進められる。最終的に生物の新視点を見つけるならなおさら。データの公開はウェットとドライどちらにとってもメリット。 #glycoinfo
2011-02-25 16:32:09
Maori Ito
@maoringo
やりたいことがたくさんあるのに、処理する人が少ない印象はやっぱ拭えないですよ。そもそも興味がある人も少ないし・・・ #glycoinfo
2011-02-25 16:46:58
Maori Ito
@maoringo
糖鎖のペトリネットを使った解析。ペトリネット→http://www.aichi-pu.ac.jp/ist/~qua/intropn/node2.html#SECTION00021000000000000000 #glycoinfo
2011-02-25 16:56:30
Maori Ito
@maoringo
Km ミカエリス定数 糖鎖でのシステム生物学に何を適用させるべきか。いきなり多くの式を代入すると爆発する。#glycoinfo
2011-02-25 17:07:02
Maori Ito
@maoringo
シミュレーションの意義とは?結構意見に違いがあるみたいです。シミュレーションで新規性が見つからなかったら、それに意味があるのか。系が再現できたらそれは意味があることと捉える人もいる。#glycoinfo
2011-02-25 17:11:59
Maori Ito
@maoringo
PAM,BLOSUMの糖鎖版,文字列が似ているからと言って似ているとは限らない。アフィニティーデータ、糖鎖アレイのデータ(CFG,糖鎖アレイのデータ)実験データを入れ込んだデータ検索をしたらどうか(してるとちゅう)#glycoinfo
2011-02-25 17:30:05
Maori Ito
@maoringo
結合特異性を決めるアミノ酸残基の特定、設計 ーレクチン、糖鎖関連酵素の結合情報から出来るのではないか。#glycoinfo
2011-02-25 17:30:45
Maori Ito
@maoringo
できそうなこと プロテオームDBの構築 翻訳後修飾(N-,O-結合糖鎖)についての情報が得られるDB #glycoinfo
2011-02-25 17:33:20