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uchida_kawasaki
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さと う🌛
@mebaruhirame
PCRCt45について マニュアルでCt45まで回すことになっています。 その理由が、これです。 検査プロセスが正常に進んでいるか、陽性、陰性コントロールを入れており、検査精度を保証しています。 45まで回すことで、このグラフが書けます。 内部精度管理です。 検体の陽性陰性にかかわらず。 pic.twitter.com/dUzpPcJmCH
2020-11-05 02:14:44
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さと う🌛
@mebaruhirame
ＰＣＲ Ct45 A 陽性の場合 N1,2二つのプライマーが、Ct27辺りで立ち上がっています。 そして、30過ぎで、陽性コントロールが立ち上がり、陰性コントロールは、立ち上がらず、 正常な検査ができていることを証明してます。 検査正常で、Ct27です。
2020-11-05 02:22:58
さと う🌛
@mebaruhirame
ＰＣＲ Ct45 B陰性の場合 N1,2、Ct40過ぎても立ち上がらず。 陽性コントロール（IC）が正常に立ち上がり、陰性コントロール2本は立ち上がりません。 検査は、正常で、陰性判定です。
2020-11-05 02:28:37
さと う🌛
@mebaruhirame
ＰＣＲ Ct45 Cシグナルがでない 検査異常。 陽性コントロール（IC）が立ち上がらず、検査が異常です。 このように、Ct45まで回して内部コントロールの増幅をみで、検査を保証。 内部精度管理！ Ctをいくつまで回すかは、試薬等のシステム上の要求でもあります。 an.shimadzu.co.jp/bio/reagents/c… pic.twitter.com/g6pCCyx5LO
2020-11-05 02:38:20
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さと う🌛
@mebaruhirame
ＰＣＲ Ct45 ＰＣＲと一口に言っても、同じウイルス量でもキットでCt値は、大きくかわります。 同様に、分析上Ctをいくつまで回すかは、キット毎に異なります。 twitter.com/mebaruhirame/s…
2020-11-05 02:46:32
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ｃt45 日本のPCRの種類 感染症指定病院等の 大病院アンケート N=117 感染研処方 37 ロシュ 22 島津 29 その他 29 twitter.com/mebaruhirame/s…
2020-11-05 03:00:07
さと う🌛
@mebaruhirame
コロナ検査に関するアンケート 一般社団法人日本臨床検査医学会 COVID-19 の検査における アンケート調査結果 COVID-19への対応を議題で準備を進めるため各施設検査部門の COVID-19 検査への対応を調査 第1、2種感染症指定医療域間 、 協力病院等 jslm.org/about/zenkoku/… pic.twitter.com/yZs9pspAFK
2020-11-02 00:24:22
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@mebaruhirame
PCR Ct45 感染研処方では、最終分析検体で5コピーが、Ct38相当のようだ。 つまり、これ以上のCtの検体は、ほぼない。 増幅用最終分析検体なので、採取綿棒で計算すると、1000～3000程度のウイルスがある計算になる。 空中を漂うウイルスがたまたま付着するレベルでない twitter.com/mebaruhirame/s…
2020-11-05 03:12:00
さと う🌛
@mebaruhirame
感染研処方 京都大学のレポート 「SARS-CoV-2 核酸検出」PCR 反応系の比較検討 感染研処方でのCt値とウイルスコピー数 三回測定。 5コピー程度は、測定困難のようだ。 50コピーは、必要か。 『NC (38.5, >40, negative)』の記載のように、濃度低いと再現性困難。 kuhp.kyoto-u.ac.jp/~ict/clm/wp-co… pic.twitter.com/l0rMQPveDE
2020-11-04 00:08:59
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 増幅曲線での検体のCtの見方。 図の立ち上がるところを読む。▲のところ。 つまり、検体Ct以上に回す。 必ず。 立ち上がりを、ある一定の蛍光量に達したら読む場合と、二回微分して、読むとかで決定する。 CtはCpと表現する場合もある。 twitter.com/mebaruhirame/s…
2020-11-05 03:22:40
さと う🌛
@mebaruhirame
メモ1 各ウイルス濃度で三反復測定 濃度の低い10の１乗あたりから、サンプル採取時のバラつきのため、再現性低下。 限界濃度とは、実はサンプリングのバラつきだ。 PCRそのものは、正直に増幅して留。 Cp Crossing Point pic.twitter.com/xcjUoDtvWr twitter.com/ramos59454108/…
2020-09-28 21:15:37
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 陽性者判定された実際のCt値分布 なんと Ct35以下が61/62例 前述のようにCt38あたりが、検査検体で5コピーの検出限界だから、Ct35超えは希である。 外国の例でも34.5を超えるCtの個人の割合は、3.6%との記述が論文内にある（但し未発表のデータとのこと）。 twitter.com/mebaruhirame/s…
2020-11-05 03:38:23
さと う🌛
@mebaruhirame
@funkyfungifun @sunasaji ありがとうございます。 これ知りたかった。 本当に少ないですね。 それと、このデータは、４月の始め なので、検査遅れが想像されるので、今はもっと少ないかも。 pic.twitter.com/JoJ97GAxpx
2020-10-11 03:49:28
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 結論 ①Ct45あたりまで『分析のため』まわす』。精度管理！ ②45かどうかは、キットで異なる。キット差。多様なキット。 ③感染研処方で言えば、Ct38程度で、最終分析検体で、5コピー。 Ct40は、その1/4。もう検出限界。最終分析検体にウイルスがない確率発生。 以上 分析視点から。
2020-11-05 09:05:36
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 分析は、取説のとおり回す単なる技術要件。 しかし、 分析Ct値と『陽性』判定Ct値は、異なってもよい。 台湾や中国は、そうしているようだ。Ct35or37まで陽性。超えて検出された場合疑陽性とか。 但し、この二国は、『隔離第一主義』。 接触『可能性』だけで、隔離する。日本では無理。
2020-11-05 09:20:24
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 日本で、Ct値統一できるか？ ⇒無理である。14種類以上の検査キットが、既にある。 キットの性能、技術要件は、各々異なる。 どうしても、統一したいなら、Ctでなく、ウイルス濃度基準だろう。 ウイルス数X個から陽性とし、各キットで該当Ct設定………無理！！ pic.twitter.com/jjVJ3Ns2Pv
2020-11-05 09:31:41
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さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 Ct35以上は、『生きた』ウイルス少ないから……… ⇒そのとおりだが、 ①機種多様でCt一律論議不能。 ②可能性あれば隔離が、拡大防止に有効。 人権とのバランスは別論議 ③Ct35以上は少ない。 （逆のニュース記事はあるが、いまのところ、データがない。あれば、検討・訂正する。）
2020-11-05 09:46:40
さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 イギリス政府のCt説明文書 ・Ct値は、異なる試験法では、 直接比較できない ・英国には、多くのPCR試験法がある ・試験法によって、検出限界も異なる ・標的遺伝子も、単数、複数、様々 ・試薬量も異なる ・検査時の液量も異なる ・典型的なCtは最高40 assets.publishing.service.gov.uk/government/upl… pic.twitter.com/i4cT4pDnM6
2020-11-05 22:47:32
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さと う🌛
@mebaruhirame
PCR CT45 米国 FDAも特に決めはないようだ。 (Twitter) 詳細未確認。 画像は、その一例。 PCRは、XpertXpressでCt45 twitter.com/ifihadastick/s… pic.twitter.com/UHBacd2bUY
2020-11-05 23:21:19
Josh Stevenson
@ifihadastick
The FDA, with their Emergency Use Authorizations, have issued Molecular Diagnostic Templates for PCR test manufacturers that referenced 40 Ct, but stated in an email to New York Times that they "do not specify" the threshold setting. fda.gov/media/135900/d… /6
2020-09-21 22:05:39
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さと う🌛
@mebaruhirame
PCR Ct45 Ctと発症後の経過日数は色々データある。 こういう図を見ると、初期でもCt40あたり沢山いるので、Ct45回して、Ct40判定かなと思うけど。 まあ、論議しない。 個人ごとの綿密な追跡必要だし、感染者基準は、難しい。 A*STAR Fortitude Kit シンガポール製 academic.oup.com/ofid/article/7… pic.twitter.com/GoQ7kQtbgJ
2020-11-06 00:10:10
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内村航平選手 PCR検査で陽性後、別の検査会社で陰性。最初の検査で陽性となった原因を検証する事が必要(2020.11..
理論上、PCR検査で偽陽性は無い。
あるとすると「コンタミ」。
そして検査時は「陽性」。その後、PCR検査で「陰性」になったとしたら、最初PCR検査以前は「陽性」と言う事を意味する。
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