NASA「宇宙生物学上の発見」 2011/2/28 updated
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marianna_ave
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Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
Scienceの原著論文読んでみた。が、イマイチ定量性がなくてしっくりこない。どうやら細胞中のAs:P比が7:3なので、幅広くヒ素に置き換わっているのは間違いないが、Table 2とTable S2でDNA/RNA中のヒ素量比が合わないし、どこを優先しているか、はわからない。
2010-12-03 06:19:25
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
ヒ素の毒性はthiolを標的とするので、GFAJ-1は少なくともシステインを避け、ジスルフィド結合もあまり使わずに生きている可能性が高い。ますますゲノムを見たいぜ。
2010-12-03 06:50:47
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
ヒ素の毒性は容易にリン酸を置き換えることにもよるらしい。http://bit.ly/heC1oV 少なくともコハク酸存在下ではADPと結合してATPっぽいADP-Asに酵素なしでなれるようだ。http://bit.ly/hgCmB2 これにより代謝物の置換も普通に見られるらしい。
2010-12-03 06:59:40
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
dNTPがDNAに取り込まれるときにピロリン酸がエネルギーと共に放出され、dNMPがDNAに残る。ヒ素がDNAに残るためには、少なくともdNAs-P-Pがないと、高エネルギー結合がつくれなそう（？）。よって、As-Pが高エネルギー結合たりうるのか教えて、化学のエロい人！
2010-12-03 07:13:41
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
やっぱり高エネルギー結合は鍵っぽい。思うに、完全にヒ素だけしかない環境ではGFAJ-1は生きれないのではないか。高エネルギー結合以外（例えばN-As-P-Pみたいな形で）だけ置換していて、それが7:3というバランスなのではないか。（正確には6.66:3.33に近いのでは）
2010-12-03 07:20:36
Kazuharu Arakawa
@gaou_ak
N-As-P-PとN-P-P-ASは泳動時間違うはずだから、CE-MSなら見分けられるはず。サンプル量の問題はあるけど、ここはメタボロミクスをやるべきでしょう！@horikawad さん経由で共同研究できないだろうか。
2010-12-03 07:24:21
クマムシ博士
@horikawad
ツイート有り難うございます！期待していた発見で興奮しました！@pollyanna_y これはすごい。そして @horikawad さんの予想大当たり。 / asahi.com（朝日新聞社）：ヒ素食べる細菌、ＮＡＳＡなど発見 生物の「常識」覆す
2010-12-03 08:43:20
クマムシ博士
@horikawad
@gaou_ak ちょっとツテを辿ってみようと思います。gaou_ak N-As-P-PとN-P-P-ASは泳動時間違うはずだから、CE-MSなら見分けられるはず。サンプル量の問題はあるけど、ここはメタボロミクスをやるべきでしょう！@horikawad さん経由で共同研究できない
2010-12-03 08:45:11
クマムシ博士
@horikawad
RT @kmoriyama: 「砒素で生きる細菌」に疑問の声 http://wiredvision.jp/news/201012/2010120923.html (#wiredvision)
2010-12-09 23:39:37
クマムシ博士
@horikawad
ブログ更新しました。ヒ素をDNAに取り込む細菌の発表に対する反論のまとめ| むしブロ http://t.co/3StDDTk via @horikawad
2010-12-11 02:43:47
クマムシ博士
@horikawad
有り難うございますー@Orihuret すごく面白かったです。今まで読んだNASA発表関係の読み物のなかで一番。さすが専門家ですねー（笑ヒ素をDNAに取り込む細菌の発表に対する反論のまとめ| むしブ ameblo.jp/horikawad/entr… via @horikawad
2010-12-11 12:35:44
クマムシ博士
@horikawad
NASAのヒ素生物発見についての解説と追記をしました。E.T.に恋して | リルログ | http://bit.ly/fORm9A
2011-02-21 22:11:09
maria/安倍 茉里/sabrina/
@marianna_ave
中高生に読ませたい。 @horikawad 氏のブログ情報を追加。NASAのヒ素生物発見についての解説と追記／E.T.に恋して | リルログ | http://bit.ly/fORm9A http://togetter.com/li/75047
2011-02-28 17:37:21
maria/安倍 茉里/sabrina/
@marianna_ave
いや、小学校高学年なら理解できるかも。用語が難しいかな？理科好きな子、読んでほしい。 RT 中高生に読ませたい。 horikawad 氏…NASAのヒ素生物発見についての解説と追記 http://bit.ly/fORm9A http://togetter.com/li/75047
2011-02-28 17:53:53
クマムシ博士
@horikawad
そのあたりもターゲットに考えました。 RT @marianna_ave 中高生に読ませたい。 @horikawad 氏のブログ情報を追加。E.T.に恋して | リルログ | http://bit.ly/fORm9A http://togetter.com/li/75047
2011-02-28 19:39:57