2016年9月21日

STAP細胞と核移植クローン-129X1ミトコンドリアDNAの謎

STAP細胞で使用された日本SLCが市販している129X1という種類のマウスのミトコンドリアDNAはB6で汚染されているため、129♀とB6♂を掛け合わせた129B6マウスのミトコンドリアDNAは本来は129であるはずがB6になっていて、それゆえにB6♀と129♂をかけあわせたB6129（大田・若山照彦博士2005年論文で129B6と書かれた核移植ES細胞は解析の結果B6129と判明した）と区別がつかないと科学者の方々は会話されていましたが、本当でしょうか?

科学 DNA ミトコンドリア研究不正 STAP細胞

pririn_
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2480 @_12480

@jyouhou_syusyu Q1系：この発言が若干情報錯綜を呼んでるようなので"Xは大半がB6由来なので129B6"twitter.com/caripso/status… 詳しげな方に一言欲しかったのです。 Q2系：まだ考えてないので趣味近げな人に訊いてみただけなのです。ｽﾐﾏｾﾝ

2014-07-03 19:13:25

Endo, Takaho @caripso

@druoh @pririn_ RNAseqのデータを見るとXは大半がB6由来なので129B6でよいと思います．ちなみに18番はほとんどがB6で，若山研オリジナルの129マウスは18番はほぼ組換えなしのB6の模様．

2014-06-23 14:10:28

Endo, Takaho @caripso

@_12480 @jyouhou_syusyu 横からすいません．表記についてはミスでしたが，まだどちらか確定していないというのが正直なところです．Yとミトコンドリアも見たのですがまだ特定に至っていませんし，Xもまだ情報が不十分なのです．

2014-07-03 20:15:23

Endo, Takaho @caripso

@_12480 @jyouhou_syusyu 何故かと言うとChr18-GFPの129はB6からバッククロスしたものなのでところどころB6の領域があります．XについてもB6型といっても129の親がもっていた可能性も否定出来ないため，当面NGSデータから確定はできません．

2014-07-03 20:20:28

トクロンティヌス @jyouhou_syusyu

@caripso @_12480 Tg(CAG-EGFP)の原系統が129なんですか？マイクロインジェクションで129はまず使わないので、ES使って作られたってことでしょうか？

2014-07-03 20:23:02

Endo, Takaho @caripso

@jyouhou_syusyu @_12480 私の理解が間違っているかもしれませんが，原系統がB6で129に20代交配してGFPを残したものだと思っています．129がなくB6のSNPsばかりが連続する領域がいくつかあります．

2014-07-03 20:40:46

トクロンティヌス @jyouhou_syusyu

@caripso @_12480 129.B6-Tg(CAG-EGFP)ですか...持ってるところ限られそうですね...B6のSNPだけが連続する領域があるってことはまだコンジェニックが完了していないように感じます。由来探しはそこが手掛かりになりそうですね

2014-07-03 20:46:00

Endo, Takaho @caripso

@jyouhou_syusyu @_12480 あ，いえ．今の話は若山研オリジナルのChr18-GFPマウスの話です．由来不明の方もいくつか特徴はあるでしょうが，まだこれから．NGSデータに含まれるかどうかも不明ですし．

2014-07-03 20:48:49

トクロンティヌス @jyouhou_syusyu

@caripso @_12480 そうでしたか。たぶん若山研のオリジナル129.B6-Tg(CAG-EGFP)はコンジェニックが完全には行われていないと思います。20世代って結構な時間かかるし、当時はまだバッククロスを4~8世代くらいするような風潮でしたし

2014-07-03 20:51:14

トクロンティヌス @jyouhou_syusyu

@caripso @_12480 ありがとうございます。XやYのアレルがどちらなのか、分かればいいですね

2014-07-03 20:17:23

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