#新型コロナウイルス PCR検査における特異度・偽陽性・偽陰性と、スクリーニングに関する考察(2020.3.8作成)

3
まとめ 【コロラドさん解説】#新型コロナウイルス における『致命率と感染致命割合』の混同による混乱と、日本に待ち受けるものは.. 致命率 (CFR: Case Fatality Rate)分母は確定診断患者数。 感染致命割合(IFR: Infection Fatality Rate)分母は感染者総数。 分子は、診断のついた死者数。 6909 pv 119 5 users 196
東京GIGO @ekb90377

引用:東洋経済ONLINE「新型コロナウイルス国内感染の状況」 最終更新:2020年3月6日 toyokeizai.net/sp/visual/tko/…

2020-03-07 17:53:51
リンク toyokeizai.net 新型コロナウイルス 国内感染の状況 日本国内において現在確定している新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の状況を厚生労働省の報道発表資料からビジュアル化した 95 users 2549
東京GIGO @ekb90377

3/4(水)のPCR検査数が3,835件と突出しているのが目を引くが、グラフの注記を見ると集計方法が3/4(水)以降で変わったようで、以前に実施したものの報告が一度に上がって来たのが3/4(水)と言うことのようだ。たぶん。

2020-03-07 18:09:01
東京GIGO @ekb90377

3/5(木) 検査数:258 陽性者数:33 有症数:30 3/6(金) 検査数:699 陽性者数:31 有症数:26 これを見ると、陰性100人のうち10人を偽陽性、90人を真陰性と判定して90/(90+10)=90で特異度が90%だとか、特異度がそこまで低い(本当は陰性なのに間違って陽性としてしまう)はなさそうに思える。

2020-03-07 18:22:50
東京GIGO @ekb90377

3/6(金)の累計では、 検査数:6,647 陽性者数:333 有症数:302

2020-03-07 18:50:19
東京GIGO @ekb90377

累計の陽性者333の全員が偽陽性だとしても特異度は95%。陽性者はPCRだけでなくインフルなど他の検査もやっているだろうし、陽性者中の有症数も90%以上あることを踏まえれば、特異度は99%以上あるのではないだろうか?冤罪に例えて言えば、冤罪率1%以下。

2020-03-07 18:51:56
東京GIGO @ekb90377

PCR検査で陽性になった人は、隔離・治療したり、無症状でも外を出歩くのを当面の間ご遠慮いただくのは、いたしかたないと言えるのではないか。

2020-03-07 18:54:40
東京GIGO @ekb90377

室月淳@集英社新書「出生前診断の現場から」発売中@junmurot氏のツイートより以下引用: pic.twitter.com/OuixqqHQpf

2020-03-07 19:29:57
拡大
東京GIGO @ekb90377

引用:1日1万件以上の検査など狂気の沙汰で,偽陽性が毎日何百人もでてきて,その多くのひとたちが殺到して医療機関をパンクさせます.健康人を14日間も拘束隔離したり,レッテルを貼って差別したりする重大な人権侵害を招きます.:引用終わり

2020-03-07 19:31:11
東京GIGO @ekb90377

CoVID-19のPCR検査に関して言えば、特異度90%と言う想定が実態とかけ離れていることは、これまでの累計検査結果より明らか。 どのような検査も、実態とかけ離れた感度・特異度を設定すれば「こんなのやらない方がいい」となる。 これまでの検査結果を踏まえたエビデンスをベースとした議論が必要。

2020-03-07 19:33:18
東京GIGO @ekb90377

PCR検査の特異度についてもう少し考察してみる。 特異度が仮に90%であれば、6,647の検査により665の偽陽性が発生する。これらは偽陽性なので症状はない。

2020-03-08 02:04:34
東京GIGO @ekb90377

厳密に言えばインフルやその他の疾患等で、たまたまCoVID-19類似の症状になっている人も含まれるが、その割合は、今この瞬間に世間一般でそういう状態になっている人の割合になるので、たぶん人口の5%も行かない。

2020-03-08 02:05:10
東京GIGO @ekb90377

またインフルであればインフル検査のスクリーニングで多くがはねられる。なのでオーダー見積もりにおいてはほとんど無視してよい。

2020-03-08 02:05:22
東京GIGO @ekb90377

3/6(金)の累計の陽性者数333に対して有症数は302なので、無症数は31。 特異度90%による665の偽陽性とは桁で合致しない。 仮に特異度99%としてみても偽陽性は67。まだ無症数31とは倍の開きがある。

2020-03-08 02:06:02
東京GIGO @ekb90377

CoVID-19が無症状でも感染力を持つことを踏まえるとかなり考えにくいことではあるが、無症数31が全て偽陽性だとした場合の特異度が、保守的(特異度がなるべく低い側)の見積もりとなる。 1から31/6,643を引いてパーセントにすると、99.5%くらい。冤罪に例えれば、冤罪率200分の1以下。

2020-03-08 02:06:33
東京GIGO @ekb90377

以後、簡単のために人口1万人で考える。また以後の数字は全部(仮)。

2020-03-08 02:06:56
東京GIGO @ekb90377

人口の0.1%(仮)が感染しているとすると、感染者は1万人中10人(仮)。感度についてはデータ不足で見当がつかないが、50%(仮)だとすると1万人を皆検査して10人のうち5人(仮)を真陽性として検出し、特異度99.5%(仮)とすると50人(仮)を偽陽性として検出するので、陽性的中率は9%(仮)となる。

2020-03-08 02:07:50