PCRデマが発生した理由は、単純にPCR検査の仕組みが解っていなかったから

カットオフで陽性陰性判断するんじゃなくて遺伝子があるか無いかで判断するっていう話。
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まとめ PCR検査が増えないのは、ハンセン病の隔離政策で世間から批判され、人権侵害に敏感になっているから? ハンセン病って隔離が不要なものを隔離し続けたからアカンのであって、COVIDは隔離が必要だろう。そもそも武漢チャーター便で陰性も2週間ホテル三日月とかで隔離してたやんけ。 2818 pv 9 4 users
Noguchi Akio @Derive_ip

PCRデマが発生した理由(とりあえず陰謀説は否定する)は、単純にPCR検査の仕組みが解っていなかったのだと思います。そもそもPCRの検査は例の2×2の表計算を使うべきではありませんでした。あの2×2の表計算の背後には図のような頻度分布があることが前提だったのです。1/n pic.twitter.com/dtI0dLeq2z

2020-07-23 22:51:05
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Noguchi Akio @Derive_ip

確かに、このような分布が得られる検査であれば、疾患群が少ない(事前確率が低い)場合は、カットオフを超える被験者が偽陽性ばかりになるし、坂本史衣のいうように「感度、特異度はトレードオフの関係」になるかもしれません。2/n buzzfeed.com/jp/naokoiwanag…

2020-07-23 22:51:06
Noguchi Akio @Derive_ip

でも、PCRの検査は上記分布が得られるような検査ではないですよね。検体を採取して装置にセットしたときにプライマーに反応するDNA/RNAがいくつ残っていますかの問題で、こんな感じの増幅曲線が得られるというものです。つまり、本質的に2×2の表計算の出番が無い。3/n pic.twitter.com/KaV9u6ubUz

2020-07-23 22:51:06
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Noguchi Akio @Derive_ip

結局のところ、例の2×2の表計算を使って御議論していた人って、2×2の表計算がある種の確率『分布』の計算をするための『つるかめ算』みたいなものだということが理解できていなかったということでしょう。大人になったら『つるかめ算』を使える場面であるかも考えるべきですよね。4/n pic.twitter.com/fCAM6nJwKc

2020-07-23 22:51:06
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Noguchi Akio @Derive_ip

それと忽那賢志も本事件の立役者なのですが、彼が図を翻訳して紹介したJAMAの論文にはちゃんとSpecificity of most of the RT-PCR tests is 100% because the primer design is specific to the genome sequence of SARS-CoV-2.と書いてあります。5/n news.yahoo.co.jp/byline/kutsuna… news.yahoo.co.jp/byline/kutsuna… pic.twitter.com/YnsK57ZY4D

2020-07-23 22:51:07
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Noguchi Akio @Derive_ip

忽那賢志は3密理論の根拠として下記論文の紹介の際にも「「3密空間」にいる感染者は、いない感染者よりも18.7倍も他の人へ感染させやすい」としていますが、そうは書いてないですよね。medrxiv.org/content/10.110… 彼は紹介する論文をよく読まない傾向があるのかもしれません。6/n

2020-07-23 22:51:07
Noguchi Akio @Derive_ip

特異度が99.9999%であっても決して100%でないという言い訳を認めたとしても、分布を考えればそこはいわゆる『外れ値』ですから『外れ値の期待値計算』みたいな謎計算をしてはダメです。気取って「95%信頼区間」とか言ってますが重要なのは計算可能な分布の存在です。7/n buzzfeed.com/jp/yutochiba/c…

2020-07-23 22:51:08
Noguchi Akio @Derive_ip

尾身の「偽陽性は検査前確率(事前確率)が低くなればなるほど、増えてくる。それが、この検査の特徴です」というのも間違いです。むしろそうでないのがPCR検査の特徴で、にも拘わらず『つるかめ算』を適用していること自体がすでに誤りなのです。8/n buzzfeed.com/jp/yutochiba/s…

2020-07-23 22:51:08
Noguchi Akio @Derive_ip

以上、検査抑制論の周辺には、まだまだ出鱈目は話が沢山あると思いますが、私が気付いた部分をまとめてみました。9/9

2020-07-23 22:51:08

補足1

Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2 ではPCR検査の特異度について

Specificity of most of the RT-PCR tests is 100% because the primer design is specific to the genome sequence of SARS-CoV-2. Occasional false-positive results may occur due to technical errors and reagent contamination.

SARS-CoV-2固有の遺伝子でプライマーが設計されているので、RT-PCRの特異度はたいていの場合100%です。技術的エラーや検体汚染で偽陽性が発生する可能性はあります。

とされています。

https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2765837

補足2

感染がある程度コントロールされている先進国では、陽性率は1%を切るレベルになっています。例えばこれらの大半が偽陽性と考えるのは無理があるでしょう。

kame4477 @kame4477

直近一週間の検査陽性率(%) 日本4.5 イギリス0.6 ドイツ0.5 イタリア0.5 韓国0.5 台湾0.4 NZ0.1 pic.twitter.com/e3m71syTuh

2020-07-23 10:07:54
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